E-鈣粘附素序列模體分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、E-鈣粘附素(E-cadherin，E-cad)是一種粘附分子，是細胞粘附素家族(Ca2+dependent cell adhesion molecule family)中的一員，主要介導(dǎo)細胞間同質(zhì)粘附的鈣依賴性跨膜糖蛋白，對維持正常上皮細胞形態(tài)和結(jié)構(gòu)完整性起著重要作用。模體是蛋白質(zhì)序列中的一段保守區(qū)域，保守性通常在進化過程中呈現(xiàn)，對研究蛋白質(zhì)的功能起著重要作用。因此，通過對E-鈣粘附素序列模體的特征分析來研究E-鈣粘附素的結(jié)構(gòu)和功能具

2、有重要意義。本文中，利用搜索序列模體的方法找到了E-鈣粘附素序列的功能模體。
　　為了更好地理解E-鈣粘附素的粘附機理，本文從數(shù)據(jù)庫Swiss-Prot提取了實驗上已經(jīng)確認的142條E-鈣粘附素序列，利用InterPro、MEME、PROSITE等分析工具對序列一致性(identity)(序列之間完全相同的部分所占的比例)小于等于25％的E-鈣粘附素序列進行模體搜索。通過InterPro確定了14條主要的功能模體，用MEME分析得

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