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1、二十二碳六烯酸(Docosahexaenoic acid, DHA)是長鏈多不飽和脂肪酸,對神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育及視力保護(hù)至關(guān)重要。本研究選取的裂壺藻(Schizochytrium sp. TIO01)具有生長速度快、發(fā)酵周期短、高產(chǎn)多不飽和脂肪酸等特點,是目前工業(yè)化生產(chǎn)DHA的熱門菌種之一。根據(jù)已有報道可知低溫能顯著提高裂壺藻DHA的積累,為了研究參與該生物過程的關(guān)鍵調(diào)控蛋白,本論文分別選取30℃對數(shù)期(30log)和15℃對數(shù)期(15log
2、)的裂壺藻,進(jìn)行生理生化指標(biāo)測定、轉(zhuǎn)錄組測序、差異表達(dá)基因分析及Q-PCR驗證等,試圖從轉(zhuǎn)錄水平上研究低溫促進(jìn)DHA積累的分子機(jī)制。具體的研究結(jié)果如下:
1)裂壺藻在30℃對數(shù)期DHA占總脂肪酸含量的百分比為48.36%,15℃對數(shù)期DHA占總脂肪酸含量的百分比則達(dá)67.38%;
2)一共測了100.01 Gb數(shù)據(jù),組裝并去冗余后得到43,550個Unigene,總長度,平均長度,N50以及GC含量分別為54,436
3、,700 bp,1,249 bp,2,526 bp和47.60%;DEG檢測結(jié)果發(fā)現(xiàn),15log vs30log之間有376個上調(diào)基因和50個下調(diào)基因;
3)選取10個差異表達(dá)基因進(jìn)行實時熒光定量PCR,其中9個基因差異表達(dá)的趨勢與轉(zhuǎn)錄組結(jié)果一致,表明轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)準(zhǔn)確可信;
4)對差異表達(dá)基因進(jìn)行KEGG富集分析發(fā)現(xiàn)與DHA合成相關(guān)的脂肪酸代謝通路中,低溫條件下FAS途徑中脂肪酸合酶及PKS途徑中脂肪酸合酶等多個相關(guān)基
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