蠶蛹蛋白源ACE抑制肽的抑制機(jī)理及構(gòu)效關(guān)系研究.pdf

1、本文主要對蠶蛹蛋白水解得到的ACE抑制肽進(jìn)行抑制機(jī)理研究，具體內(nèi)容包括三部分:(1)蠶蛹蛋白源ACE抑制多肽GAMVVH的理化性質(zhì)、抑制類型進(jìn)行了探究，并用分子對接軟件和分子動力學(xué)軟件對其分子結(jié)合點位，分子動力學(xué)進(jìn)行了探究;(2)通過實驗及分子對接對蠶蛹蛋白源ACE抑制多肽NR、YLR單獨作用于ACE時的抑制機(jī)理以及兩者同時作用于ACE時的相互作用進(jìn)行了探討;(3)采用CoMFA和CoMSIA分析方法，對不同肽鏈長度的食源性ACE抑制多

2、肽進(jìn)行了3D-QSAR分析。主要研究成果如下:
　　(1)多肽GAMVVH的IC50為19.3±0.21μM，且具有良好的熱穩(wěn)定性和抗消化。Lineweaver Burk抑制動力學(xué)曲線表明，多肽GAMVVH對ACE為競爭性抑制，Ki=0.506×10-5M。此外，通過分子對接和GROMACS分子動力學(xué)模擬發(fā)現(xiàn)，GAMVVH與ACE的Gln281(1.7(A))，His353(2.2(A))，Ala354(1.9(A))，Asp45

3、3(1.8(A)/2.2(A))和Lys511(2.0(A))等氨基酸殘基形成氫鍵。ACE中鋅正四面體結(jié)構(gòu)在GAMVVH的作用下發(fā)生變化，鋅離子由四配位變?yōu)楦€(wěn)定的六配位，并且原鋅正四面體中氨基酸殘基His387被氨基酸殘基Glu384代替，經(jīng)測量GAMVVH與鋅離子之間的距離為2.5(A)。
　　(2)多肽NR和YLR的抑制活性分別為17.8μM和15.1μM。Lineweaver-Burk抑制動力學(xué)曲線表明，兩種多肽的抑制類型

4、均為非競爭抑制，(Ki=2.11×10-5 M(NR)和Ki=1.87×10-5 M(YLR))，且抑制劑YLR與ACE的結(jié)合力大于抑制劑NR。分子對接顯示多肽NR與ACE的Ala354(2.0(A)), Glu384(1.9(A)),Asp415(2.0(A)),Lys511(2.2(A))和Tyr520(2.0(A))等氨基酸殘基形成氫鍵。多肽YLR與ACE的Gln281(2.1(A))，His353(2.3(A)), Ala354

5、(2.3(A)),Glu384(2.3(A)),Asp415(2.1(A))和Lys511(2.2(A))等氨基酸殘基形成氫鍵。并且將對接構(gòu)象型疊合，發(fā)現(xiàn)多肽NR和多肽YLR在ACE中的空間位置存在部分重疊。
　　(3)本文以食源性ACE抑制肽為基礎(chǔ)，采用CoMFA和CoMSIA分析方法，對三個數(shù)據(jù)集共102種不同力場組合逐一進(jìn)行分析，最終獲得適合二肽、三肽和四至六肽的3D-QSAR力場，并建立對應(yīng)3D-QSAR模型（二肽:CoM