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文檔簡介
1、血管緊張素轉(zhuǎn)化酶(angiotensin converting enzyme,ACE)抑制劑一直是抗高血壓藥物研究方向的熱點。而食物蛋白源ACE抑制肽因為其安全,副作用小,易吸收等特點而被廣泛關(guān)注。本文對以酪氨酸為端基的ACE抑制三肽進(jìn)行定量構(gòu)效研究建模,通過模型篩選出未經(jīng)報道的高活性三肽進(jìn)行體外活性驗證。并選出活性良好的三肽進(jìn)行分子動力學(xué)模擬和核磁共振波譜研究,來探究三肽的微觀結(jié)構(gòu)與活性之間的關(guān)系。論文由以下三部分組成:
第
2、一,收集以酪氨酸(Tyrosine,Y)為端基的ACE抑制三肽的活性數(shù)據(jù)。通過以三種不同的氨基酸描述子Z-scales,ISA-ECI,MS-WHIM對以酪氨酸為端基的ACE抑制三肽進(jìn)行定量構(gòu)效關(guān)系研究,用最小二乘法進(jìn)行多元線性回歸建立數(shù)學(xué)模型進(jìn)行分析和預(yù)測,對三種模型的預(yù)測和可靠性進(jìn)行比較和分析。結(jié)果表明酪氨酸端基ACE抑制三肽運(yùn)用經(jīng)典描述子Z-scales建立的QSAR模型最好。并通過該模型預(yù)測未報道的該類三肽的活性值。其QSAR研
3、究結(jié)果顯示,以酪氨酸為端基的ACE抑制三肽第二位氨基酸的電性參數(shù)是抑制活性的最大影響因素。而第一位氨基酸的疏水性,分子體積以及空間屬性對整個抑制肽的影響力位居其次。通過模型預(yù)測和篩選,得出三肽IRY,IEY,LRY等的活性較強(qiáng)。
第二,對由模型篩選出的未報道三肽進(jìn)行合成,并通過體外活性實驗驗證出這些三肽的IC50值。設(shè)計比對因素實驗,以濃度吸光度等參數(shù)為參考標(biāo)準(zhǔn),對實驗過程中條件選擇進(jìn)行優(yōu)化調(diào)整,并確定最佳方案。運(yùn)用苯磺酰氯比
4、色法測定一批模擬預(yù)測結(jié)果顯示具有較強(qiáng)ACE抑制活性的三肽,并通過同樣的方法測得常用ACE抑制劑賴諾普利的活性進(jìn)行對比。其中IEY,IRY,LEY的logIC50分別為-0.203,-0.127,-0.01,而賴諾普利的活性為-1.887,活性結(jié)果取得較理想預(yù)期。與模型預(yù)測值吻合,驗證了模型可靠性。
第三,采用分子動力學(xué)模擬(MD)結(jié)合核磁共振1H-NMR、1H-1H-COSY、1H-1H-NOESY方法對篩選出的活性最高的三肽
5、(IEY)在具有生物活性的水溶液以及強(qiáng)蛋白質(zhì)變性劑DMSO中的弱相互作用和構(gòu)象變化進(jìn)行分析。分子動力學(xué)模擬結(jié)果表明IEY在水溶液中處于伸展構(gòu)象為主,并且可以觀察到折疊現(xiàn)象,折疊和伸展構(gòu)象在不斷互相轉(zhuǎn)化中;而IEY在DMSO中以伸展構(gòu)象為主,幾乎不能觀察到折疊半折疊構(gòu)象。通過核磁共振實驗的結(jié)果驗證了兩個不同體系的MD分析的準(zhǔn)確性。
通過固定一端氨基酸進(jìn)行QSAR模型建立的基礎(chǔ)思想,對模型篩選出的活性最佳ACE三肽抑制劑進(jìn)行驗證,
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