基于二階Z變換的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)識(shí)別方法研究.pdf_第1頁(yè)
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1、本文采用二階Z變換對(duì)轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)序列進(jìn)行建模。在建模的過(guò)程中充分考慮了DNA序列中各位點(diǎn)堿基之間的依賴性，對(duì)以往所采用的經(jīng)典模型進(jìn)行了一定的改進(jìn)。在建模過(guò)程中采用二階Z變換來(lái)表示各個(gè)堿基之間的依賴性。此方法先把多條具有相同長(zhǎng)度的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)序列轉(zhuǎn)化為一個(gè)24維的向量模型，同時(shí)把待識(shí)別的各條序列也轉(zhuǎn)化為相應(yīng)的24維向量，然后計(jì)算待識(shí)別序列對(duì)應(yīng)的向量與模型向量之間在各個(gè)分量上的角度，從而得到一個(gè)24維的角度向量。最后利用訓(xùn)練集訓(xùn)練B

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