三種笛鯛屬魚類野生和養(yǎng)殖群體的SSR和D-loop序列分析.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、本文采用SSR標記和D-loop序列分析兩種分子遺傳標記的方法,分析南海海域紅鰭笛鯛(Lutjanus erythopterus)、星點笛鯛(Lutjanus.stellatus)和紫紅笛鯛(Lutjanusargentimaculatus)野生和養(yǎng)殖群體的遺傳多樣性及群體分化水平。所用10對微衛(wèi)星引物來自郭昱嵩篩選的勒氏笛鯛微衛(wèi)星引物,在6個笛鯛群體中共檢測到了78個等位基因,除Lru020在星點笛鯛中表現(xiàn)為單態(tài)外,其余均表現(xiàn)為多態(tài),

2、不同座位上的等位基因數(shù)為3~18個,平均每個座位上的等位基因數(shù)為7.8個,養(yǎng)殖群體的等位基因數(shù)目較野生笛鯛群體均有所下降。6個笛鯛群體的多態(tài)信息含量(polymorphism information content)為0.3797~0.5922,觀測雜合度(observed Heterozyg-osity)為0.9550~0.8100,紅鰭笛鯛、星點笛鯛和紫紅笛鯛的野生群體多態(tài)信息含量分別為0.5922,0.4584,0.5414,高于

3、養(yǎng)殖群體的0.5032,0.3797,0.4300。SSR標記群體遺傳變異說明三種笛鯛養(yǎng)殖和野生群體遺傳多樣性豐富,野生群體多樣性高于養(yǎng)殖群體,野生和養(yǎng)殖群體間遺傳分化系數(shù)為0.0371~0.1029,顯示三種笛鯛的野生和養(yǎng)殖群體間遺傳分化程度較弱。采用PCR擴增并測定了6個笛鯛群體共48個個體的D-loop全序列,序列長849bp,A+T(62.1%)含量明顯大于大C+G(37.9%)的含量。共檢測到35種單倍型,6個群體的單倍型多樣

4、性為0.8570~1,群體內核苷酸多樣性水平(Pi)平均為0.0130~0.0446,平均核苷酸差異數(shù)(K)為10.680~36.7500,三種笛鯛養(yǎng)殖和野生群體遺傳多樣性水平較高。紅鰭笛鯛、星點笛鯛和紫紅笛鯛的野生群體的核苷酸多態(tài)性指數(shù)分別為0.0130,0.0169,0.0446,高于養(yǎng)殖群體的0.0128,0.0161,0.0342。檢測到群體的總變異位點數(shù)為396個,其中有321個多態(tài)位點,含簡約信息位點占298個,占總序列的9

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