紅鯽BAC文庫(kù)構(gòu)建及BAC末端測(cè)序初步分析.pdf

1、湖南師范大學(xué)碩士學(xué)位論文紅鯽BAC文庫(kù)構(gòu)建及BAC末端測(cè)序初步分析姓名：易新國(guó)申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別：碩士專業(yè)：發(fā)育生物學(xué)指導(dǎo)教師：劉少軍201206譜的構(gòu)建以及群體遺傳學(xué)的分析奠定基礎(chǔ)。(3)在末端測(cè)序的基礎(chǔ)上，我們挑選了3個(gè)BAC克隆進(jìn)行了全長(zhǎng)測(cè)序，編號(hào)為1、2、3，其全長(zhǎng)分別為50982bp、15323bp、9663bp。經(jīng)GENESCAN分析，l號(hào)BAC中含有7個(gè)已注釋基因，基因名為：elementj哆2155kDcIproteintyp

2、el—like、nnnorb、similc伊t0putnt如ereversetrc￡nscr犧tnse、p優(yōu)ntivereverSetranScriptcse、transmembrnnep陽teinl96一li娩、hypotheticc【lp“oteinsTHERM、oRF2一encodedprotetn，基因平均長(zhǎng)度為4515bp，其中5個(gè)基因預(yù)測(cè)到具有啟動(dòng)子，另外，l號(hào)中還含有2個(gè)未注釋基因；2號(hào)BAC克隆含有紅鯽雌二醇受體B的部分

3、核基因組序列，該序列含有5個(gè)外顯子序列和5個(gè)內(nèi)含子序列，將獲得的雌二醇受體B的部分編碼區(qū)序列與鯉魚、斑馬魚、青熊、河豚等的相應(yīng)DNA序列進(jìn)行了比較并進(jìn)行了進(jìn)化樹分析，結(jié)果發(fā)現(xiàn)紅鯽與鯉魚的同源性最高；3號(hào)BAC經(jīng)測(cè)序發(fā)現(xiàn)是由36個(gè)長(zhǎng)度為263bp的串聯(lián)重復(fù)序列組成，該重復(fù)序列經(jīng)FISH驗(yàn)證確認(rèn)為紅鯽特異性的探針，該重復(fù)序列的開發(fā)將能夠十分清晰地闡釋異源四倍體鯽鯉的染色體組成和減數(shù)分裂過程中染色體的交換和重組。關(guān)鍵詞：紅鯽；細(xì)菌人工染色體文