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文檔簡(jiǎn)介
1、第一部分Pre-microRNA末端環(huán)內(nèi)SNP與結(jié)直腸癌發(fā)生的相關(guān)性研究
【目的】研究microRNA前體的末端環(huán)內(nèi)SNP與結(jié)直腸癌易感性和臨床病理參數(shù)之間的相關(guān)性。
【方法】
1、篩選位于pre-miRNA末端環(huán)內(nèi)的SNPs,篩選其中MAF≥0.1的作為候選SNPs;
2、收集1026例結(jié)直腸癌病人和1026例對(duì)照組的外周血樣,從中提取DNA;
3、采用MassARRAY SNP基因分
2、型平臺(tái)高通量質(zhì)譜分型;
4、統(tǒng)計(jì)分析SNP基因型與結(jié)直腸癌發(fā)病率和臨床病理參數(shù)之間的關(guān)系。
【結(jié)果】
1、在miRNASNP2.0數(shù)據(jù)庫中共找到121個(gè)位于pre-miRNA末端環(huán)的SNPs,其中17個(gè)SNPs的MAF≥0.1。
2、高通量質(zhì)譜分型平臺(tái)成功測(cè)出樣本中7個(gè)SNPs位點(diǎn)的基因型。
3、統(tǒng)計(jì)結(jié)果發(fā)現(xiàn),rs7911488與結(jié)直腸癌發(fā)病顯著相關(guān),C等位基因型是腸癌發(fā)生的危險(xiǎn)因子。<
3、br> 4、該位點(diǎn)與腫瘤最大直徑相關(guān)。
【結(jié)論】rs7911488與結(jié)直腸癌發(fā)生發(fā)展顯著相關(guān),C等位基因型是腸癌發(fā)生的危險(xiǎn)因子。
第二部分 miRSNP rs7911488對(duì)miRNA及其調(diào)控作用的影響
【目的】探索rs7911488影響結(jié)直腸癌發(fā)生的機(jī)制。
【方法】
1、測(cè)定腸癌組織樣本的rs7911488位點(diǎn)基因型和miR-1307表達(dá)水平;
2、軟件預(yù)測(cè)可能與pre-m
4、iR-1307結(jié)合的蛋白,并驗(yàn)證rs7911488對(duì)結(jié)合蛋白的影響;
3、軟件預(yù)測(cè)并驗(yàn)證miR-1307的下游靶基因。
【結(jié)果】
1、腸癌組織中miR-1307低表達(dá),與rs7911488位點(diǎn)的C等位基因型相關(guān)。
2、MBNL1可與C基因型的pre-miR-1307結(jié)合,導(dǎo)致DICER1無法與之結(jié)合,導(dǎo)致miR-1307表達(dá)下調(diào)。
3、抗凋亡蛋白Bcl2是miR-1307的直接靶基因,m
5、iR-1307的低表達(dá)導(dǎo)致Bcl2表達(dá)上調(diào),個(gè)體患結(jié)直腸癌風(fēng)險(xiǎn)上升。
【結(jié)論】rs7911488 C等位基因型pre-miR-1307與MBNL1結(jié)合,影響了DICER1的正常作用,使得成熟miR-1307表達(dá)量下降,從而導(dǎo)致Bcl2表達(dá)上調(diào),個(gè)體患結(jié)直腸癌風(fēng)險(xiǎn)上升。
小結(jié)
本論文通過研究pre-miRNA末端環(huán)上單核苷酸多態(tài)性與結(jié)直腸癌易感性之間的相關(guān)性,發(fā)現(xiàn)位于pre-miR-1307末端環(huán)上SNP r
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