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文檔簡介
1、西南大學(xué)碩士學(xué)位論文FGF家族生物信息學(xué)分析及FGF91620亞家族在羅非魚性腺發(fā)育中的可能作用姓名:曾圣申請(qǐng)學(xué)位級(jí)別:碩士專業(yè):動(dòng)物學(xué)指導(dǎo)教師:王德壽20120605兩南大學(xué)碩十學(xué)位論文了粥門4以外(粥門彳為魚類特有),都是相應(yīng)的人類陽風(fēng)的同源基因。對(duì)已知的粥嬲/,加8亞家族成員基因結(jié)構(gòu)以及系統(tǒng)進(jìn)化發(fā)生的研究,我們可以肯定粥剛,加8亞家族在進(jìn)化歷程中具有其獨(dú)特性,并且其在進(jìn)化的早期(最早可能發(fā)生在腔腸動(dòng)物海葵)即與其他尺擴(kuò)亞家族發(fā)生了
2、分離。通過對(duì)孵化后5天、30天、90天、180天尼羅羅非魚雌、雄性腺共8個(gè)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行的分析,我們發(fā)現(xiàn)尼羅羅非魚33個(gè)腓基因中有20個(gè)在性腺表達(dá)。其中9個(gè)腓存在較為明顯的性別差異,4個(gè)成員(粥F,口、陽F,∞、粥F,6、胱∞)在雌性中的表達(dá)明顯高于雄性,5個(gè)成員(粥砣、粥F,妃、粥F,乃、粥F,鈾、粥刀4)在雄性中的表達(dá)明顯高于雌性。FGF9在哺乳動(dòng)物性別決定與分化過程中具有至關(guān)重要的作用,但是FGF9/16/20亞家族成員在硬骨魚性
3、腺發(fā)育中的功能還沒有報(bào)道。通過l弭PCR和RACE技術(shù),我們從尼羅羅非魚中克隆了粥F91/,卯口亞家族中的三個(gè)成員(粥F,6、2沈和2D6)。系統(tǒng)發(fā)生、生物信息學(xué)以及共線性分析表明這三個(gè)克隆的脅就是陽F,6和加的同源基因。我們的研究還迸一步支持了硬骨魚基因組中不存在粥F9同源基因,以及粥砣D的復(fù)制僅存在于硬骨魚類中的觀點(diǎn)。通過RTPCR進(jìn)行的組織分布表明粥F,6在包括精巢和卵巢在內(nèi)的多個(gè)組織中表達(dá);粥刃∞在腦、垂體、脾臟而不在性腺中表達(dá)
4、;粥刀∞在腦、垂體、腸和卵巢中表達(dá),而在精巢中沒有表達(dá)。我們還通過嘞1t沛ePCR研究了粥F,6和腳∞在正常以及性逆轉(zhuǎn)性腺發(fā)育過程中的表達(dá)模式。這兩個(gè)基因在默卵巢和雌激素E2(17be協(xié)estradi01)誘導(dǎo)的XY卵巢中的表達(dá)都遠(yuǎn)遠(yuǎn)高于在XY精巢和芳香化酶抑制劑Fadrozole以及雌激素受體抑制劑Tamoxi鳧n誘導(dǎo)的)o(精巢中的表達(dá),并且都在孵化后120天達(dá)到最高。原位雜交顯示粥F,6和劂D的陽性信號(hào)集中在二時(shí)相的卵母細(xì)胞內(nèi)。這
5、些數(shù)據(jù)表明粥F9/,卯D亞家族可能在雌性生殖細(xì)胞的發(fā)育過程中起重要作用。綜上所述,我們?cè)谀崃_羅非魚基因組中分離到33個(gè)陽風(fēng)基因,其中有7個(gè)為本研究新分離。這些新分離的成員在新近完成基因組測序的5種麗魚科基因組中都存在,而在其他已公開的硬骨魚基因組中僅部分存在。轉(zhuǎn)錄組分析表明33個(gè)尼羅羅非魚粥風(fēng)基因中有20個(gè)成員在性腺表達(dá),它們?cè)谛詣e決定與分化以及性腺發(fā)育過程中的作用,還有待進(jìn)一步研究。對(duì)粥網(wǎng)/,卯D亞家族的表達(dá)研究表明,粥F,6和硒砣∞
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