短膜殼絳蟲線粒體全基因組序列測定和DNA多態(tài)性研究.pdf

1、短膜殼絳蟲（Hymenolepis nana）是寄生在人或嚙齒動物小腸內的一種常見的人獸共患寄生蟲，能夠引起膜殼絳蟲病。盡管短膜殼絳蟲是一種人獸共患寄生蟲，并能夠在各國引起嚴重的社會經濟問題，但短膜殼絳蟲的遺傳學、系統(tǒng)學、流行病學和生物學卻鮮為人知。短膜殼絳蟲病作為一種易于忽視的人獸共患病需引起關注。
　　本研究運用PCR方法擴增了來自中國7個不同地區(qū)的短膜殼絳蟲樣品的線粒體3段基因pnad5，rrnS和atp6，并根據這3段基因

2、進行了核苷酸序列差異和多態(tài)性分析。結果顯示3段線粒體基因的長度分別是710 bp，704~711 bp和516 bp。pnad5片段的A+T％含量是70.1%~73.5%，rrnS片段的A+T%含量為70.1%~71.7%，而atp6的A+T%含量為76.6%~77.9%。種內差異最小的片段是pnad5，為0~0.7%，atp6種內差異為0~1.4%；rrnS種內差異最大，為0～1.7%。將短膜殼絳蟲3段線粒體基因與縮小膜殼絳蟲（Hym

3、enolepis diminuta）相應片段進行序列分析，結果顯示兩者種間差異較大，rrnS片段種間差異為16.1%~17.6%；atp6種間差異為26.5%~27.1%；pnad5片段種間差異最大，為31.6%~31.7%。
　　應用最大簡約法對3段基因的拼接序列進行進化分析，結果顯示分離自不同地區(qū)的短膜殼絳蟲聚在一起，僅有張家口樣品單獨位于一個進化枝上，可見短膜殼絳蟲三段線粒體基因進化樹中，進化分支與地理分布沒有直接的關系，也

4、沒有一定的規(guī)律可循，來自同一地區(qū)的樣品不總在同一分支上，此進化分析結果支持了前人對短膜殼絳蟲可能是復合種或隱藏種的結論。
　　應用長 PCR方法對短膜殼絳蟲線粒體全基因進行測序和基因定位。結果顯示短膜殼絳蟲線粒體全長為13764 bp，一共有36個基因和2個非編碼區(qū)。其中12為編碼線粒體蛋白質基因、2個核糖體基因和22個tRNA基因。所有基因分布在重鏈上并沿同一個方向進行轉錄和復制。所有基因排列順序與其姊妹種縮小膜殼絳蟲（H. d

5、iminuta）一致。以12個蛋白質編碼基因拼接序列應用貝葉斯法、最大似然法和最大簡約法進行進化分析，結果顯示所用絳蟲線粒體基因組序列分為兩個明顯進化枝，有較高的節(jié)點支持。一個是假葉目的雙葉槽科（Diphyllobothriidae）；另一個是圓葉目。其中圓葉目的帶科（Taeniidae）、膜殼科（Hymenolepididae）和復孔科（Dipylidiidae）內分化較為明顯，獨立分支。
　　本研究測定了短膜殼絳蟲線粒體全基因