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文檔簡介
1、目的:
國醫(yī)大師鄧鐵濤教授臨床運用加味補中益氣湯治療重癥肌無力(MG)幾十年,其治療效果十分顯著。本研究以加味補中益氣湯方為例,采用數(shù)據(jù)挖掘、確定靶標、建立數(shù)據(jù)庫和虛擬篩選的現(xiàn)代計算機方法,研究加味補中益氣湯對MG的治療作用。并在君臣佐使中,找到主要針對乙酰膽堿酯酶(AChE)靶標的草藥;對于主要的抗AChE的草藥,發(fā)現(xiàn)抑制AChE化合物的主要骨架結(jié)構(gòu);以及發(fā)現(xiàn)新的AChE抑制劑;從傳統(tǒng)中藥復方得到啟發(fā),快速找到活性化合物的新
2、方法。
方法:
1.研究MG發(fā)病機制,確定AChE作為研究靶標,從蛋白數(shù)據(jù)庫中獲得AChE的晶體蛋白結(jié)構(gòu)。
2.通過數(shù)據(jù)挖掘建立中藥復方君臣佐使的化學成分數(shù)據(jù)庫和已知的AChE抑制劑的數(shù)據(jù)庫。
3.本研究采用了利平斯基五規(guī)則,進行初步的化合物的類藥性篩選。
4.采用分子二維(2D)、三維(3D)相似度疊合技術(shù)和Glide分子對接技術(shù),對中藥復方化學成分進行基于AChE抑制劑配體的虛擬篩選
3、。
5.骨架分析,得到潛在的抗AChE活性化合物新骨架,從商業(yè)數(shù)據(jù)庫中購買相同的骨架的化合物。
6.酶的活性實驗,以donepezil為陽性對照品,測定24個化合物的IC50值,通過Ellman酶分析實驗,找到了5個活性化合物。
7.用分子動力學模擬的方法進行驗證,驗證基于分子對接虛擬篩選預測活性化合物的可靠性。
結(jié)果:
通過對MG發(fā)病機制的研究,預測AChE該病的主要研究靶標。研究發(fā)現(xiàn)
4、加味補中益氣湯中的抗AChE活性成分主要是黃酮類的化合物,同時,還發(fā)現(xiàn)了一類新的抗AChE的化合物骨架,通過實驗驗證,找到了5個新的AChE抑制劑X4,X10,X11,X19和X21,IC50分別為6.5±0.23μM,11.4±2.72μM,7.1±1.34μM,10.9±0.48μM,2.3±0.15μM。分子動力學模擬表明,預測的結(jié)合自由能△G值與新的AChE抑制劑的生物活性的數(shù)據(jù)是一致的,呈線性關(guān)系。說明通過分子對接篩選活性化合
5、物的技術(shù)的可靠性。這項研究表明,新的活性化合物的發(fā)現(xiàn)可以從中藥材的活性成分骨架中得到啟發(fā)。
結(jié)論:
本研究的結(jié)論如下:
(1)加味補中益氣湯對重癥肌無力具有治療作用,其中君藥和使藥發(fā)揮了主要作用,臣藥和佐藥對重癥肌無力的治療可能具有不同的功能。
(2)主要的活性成分是黃酮衍生物類AChE抑制劑。
(3)本文發(fā)現(xiàn)了5個新骨架的AChE抑制劑。
(4)本文提供新的研究方法,從傳統(tǒng)的
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