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1、新德里金屬β-內(nèi)酰胺酶(NDM-1)最初是2009年從一名感染肺炎克雷伯氏菌的瑞典病人中發(fā)現(xiàn)。表達(dá)NDM-1的耐藥菌對(duì)除替加環(huán)素和粘菌素外的所有抗生素均有較高的耐藥性,而且現(xiàn)有β-內(nèi)酰胺酶抑制劑(如舒巴坦等)對(duì)NDM-1酶無效;NDM-1酶的基因位于細(xì)菌質(zhì)粒上導(dǎo)致NDM-1極易傳遞到附近的菌落,造成NDM-1酶廣泛傳播。自NDM-1發(fā)現(xiàn)以來不到一個(gè)月的時(shí)間,先后在十幾個(gè)國家發(fā)現(xiàn)表達(dá)NDM-1酶的菌株;截止2010年,我國已在10個(gè)省份發(fā)
2、現(xiàn)13例病人被NDM-1陽性菌株感染。因此NDM-1對(duì)人類健康構(gòu)成嚴(yán)重威脅,開發(fā)NDM-1酶抑制劑迫在眉睫。
NDM-1酶屬于金屬β-內(nèi)酰胺酶(MBLs)中的B1亞族,其活性催化中心含2個(gè)鋅離子,2個(gè)鋅離子結(jié)合了1個(gè)水分子進(jìn)攻β-內(nèi)酰胺使其水解,因此抑制鋅離子催化水解底物就成為設(shè)計(jì)NDM-1酶抑制劑亟需解決的問題。羧基、羥肟酸基、巰基和雜環(huán)等基團(tuán)對(duì)鋅離子有配位作用,可以屏蔽NDM-1中的鋅離子,因此本文在單環(huán)β-內(nèi)酰胺環(huán)、ED
3、TA、舒巴坦、卡托普利、依布硒啉和曲霉明A等母核上添加巰基、羧基、雜環(huán)和羥肟酸基等能配位鋅離子的取代基,設(shè)計(jì)出6組共112個(gè)不同母核的NDM-1酶抑制劑。
借助計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)軟件SYBYL-X2.0,將設(shè)計(jì)分子建立配體數(shù)據(jù)庫,利用該軟件的suflex-dock模塊對(duì)其與NDM-1酶進(jìn)行分子對(duì)接并打分。虛擬篩選的結(jié)果發(fā)現(xiàn):每組中均有設(shè)計(jì)分子(共72個(gè))的對(duì)接得分高于單晶復(fù)合物的自身配體(阿莫西林),并且通過分析每類對(duì)接得分高
4、的分子與NDM-1酶之間的相互作用模式來設(shè)計(jì)和優(yōu)化NDM-1抑制劑。
選擇設(shè)計(jì)的3種類型分子進(jìn)行合成,共得到22個(gè)目標(biāo)分子,其中11個(gè)化合物為新化合物。合成化合物主要包括以下3種類型:(Ⅰ)以青霉烷酸作為母核的化合物;(Ⅱ)含硫原子類化合物;(Ⅲ)依布硒啉及其衍生物。所合成化合物結(jié)構(gòu)均經(jīng)過核磁共振和質(zhì)譜的表征。
對(duì)其中11個(gè)合成化合物進(jìn)行生物活性測(cè)試,測(cè)試結(jié)果發(fā)現(xiàn):5個(gè)化合物與阿莫西林以1∶1聯(lián)用后,能提高阿莫西林對(duì)
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