三種地下鼠線粒體DNA全序列測(cè)定及系統(tǒng)進(jìn)化分析.pdf

1、本文利用長(zhǎng)PCR擴(kuò)增與引物步移法，測(cè)定了分類地位存在一定爭(zhēng)議的三種地下鼠——棕色田鼠（Lasiopodomys mandarinus）、東北鼢鼠（Myospalax psilurus）和高原鼢鼠（Myospalax baileyi）的線粒體DNA(mtDNA)全序列，并利用生物信息學(xué)軟件對(duì)這三種地下鼠mtDNA的基因組結(jié)構(gòu)和系統(tǒng)進(jìn)化進(jìn)行了分析。
　　 棕色田鼠、高原鼢鼠和東北鼢鼠的mtDNA全長(zhǎng)分別為16367 bp、16351

2、 bp、16360 bp，三種鼠的mtDNA基因組均由2個(gè)rRNA編碼基因、22個(gè)tRNA編碼基因、13個(gè)蛋白編碼基因和非編碼區(qū)組成，除8個(gè)tRNA基因及1個(gè)蛋白編碼基因由輕鏈編碼外，其余均由重鏈編碼。三種地下鼠mtDNA的基因組成和排列順序與大多數(shù)嚙齒動(dòng)物的mtDNA相同，堿基比例也與其它嚙齒動(dòng)物mtDNA堿基A+T＞C+G這一特點(diǎn)相同，棕色田鼠的堿基比例與田鼠屬（Microtus）、溝牙田鼠屬（Proedromys和絨鼠屬（Eoth

3、enomys）動(dòng)物的mtDNA堿基比例接近，而兩種鼢鼠與小鼴形鼠屬（Nannnospalax）動(dòng)物的堿基比例更為接近。三種地下鼠的蛋白編碼基因密碼子的使用、不完全終止密碼子的出現(xiàn)、tRNA中tRNASer的二級(jí)結(jié)構(gòu)缺失一臂、控制區(qū)D-loop和輕鏈復(fù)制起始區(qū)rep-origin的結(jié)構(gòu)等特點(diǎn)都與其它嚙齒動(dòng)物mtDNA中的同類結(jié)構(gòu)特點(diǎn)相似。
　　 基于對(duì)三種地下鼠mtDNA的13個(gè)蛋白編碼基因、2個(gè)rRNA基因以及Cytb基因的系統(tǒng)

4、進(jìn)化分析結(jié)果，本文認(rèn)為，棕色田鼠應(yīng)隸屬于倉鼠科(Cricetidae)毛足田鼠屬（Lasiopodomys），與田鼠屬（Microtus）、溝牙田鼠屬（Proedromys）和絨鼠屬（Eothenomys）親緣關(guān)系較近，結(jié)合形態(tài)學(xué)特征和數(shù)據(jù)，毛足田鼠屬應(yīng)作為一個(gè)單獨(dú)的屬存在;東北鼢鼠和高原鼢鼠同屬鼢鼠屬（Myospalax），與小鼴形鼠屬（Nannospalax）親緣關(guān)系較近，與鼠科、倉鼠科物種距離較遠(yuǎn)，結(jié)合形態(tài)學(xué)數(shù)據(jù)，支持鼢鼠屬單獨(dú)成