長鏈非編碼RNA在先天性脊柱側凸中的表達研究.pdf

1、先天性脊柱側凸(congenital scoliosis，CS)是脊柱側凸中的一個大類，約占全部脊柱側凸的5.19％[1]。CS定義為“由于胚胎期脊柱椎體發(fā)育異常而引起的脊柱畸形”。在先天性脊柱側凸患者中，絕大部分病情均呈現(xiàn)進展性[2]。CS在新生兒的中的發(fā)病率約為0.5-1‰[3]。CS具有進展快、畸形重等特點，治療以手術治療緩解病情為主，對家庭和社會都造成了極大的負擔。目前，CS的發(fā)病機制仍未明確，關于CS的發(fā)病機制有多種假說，主要

2、分為環(huán)境因素和易感基因兩類。但是目前現(xiàn)有的假說仍然無法很好的解釋CS的病因。
　　目前的研究表明部分的CS患者存在家族聚集現(xiàn)象，有家族遺傳傾向的約占3％，因此認為CS以散發(fā)為主[4]。國內(nèi)外學者對先天性脊柱側凸的基因組學及蛋白質(zhì)組學方面進行了大量的研究，也取得了不小的進展，但是仍然無法很好的解釋CS完整的起病機制。長鏈非編碼RNA(long non-coding RNAs，lncRNAs)是指真核細胞中一類長度超過200nt的，沒

3、有編碼蛋白功能的RNA分子[5]。近年來，lncRNAs逐漸受到了人們的關注，發(fā)現(xiàn)其在不少疾病的起病機制中都起到了重要的作用。研究中發(fā)現(xiàn)lncRNA的生物學作用非常復雜，通過多種機制調(diào)節(jié)了基因的表達過程。本研究運用基因芯片技術在培養(yǎng)的骨髓間充質(zhì)干細胞中挑選差異性lncRNA，希望從長鏈非編碼RNA的研究中，對CS的發(fā)病機制能有一些新的認知。
　　目的:
　　通過研究CS患者的骨髓間充質(zhì)干細胞，運用基因芯片技術挑選其中差異性表

4、達的lncRNA，研究其在轉(zhuǎn)錄組水平的差異性表達，探討CS可能的發(fā)病機制。
　　方法:
　　1.取5例先天性脊柱側凸患者以及5例年齡性別民族匹配的正常對照人群的骨髓，通過細胞培養(yǎng)得到骨髓間充質(zhì)干細胞;
　　2.運用Agilent4×44K全基因組芯片技術篩選出有表達差異的，并在功能方面可能對肌肉、骨骼系統(tǒng)發(fā)育有所影響的lncRNA。
　　結果:
　　1.通過基因芯片技術及Pathway分析、GO(Gene

5、ontology)分析后挑選出3個目標mRNA，NM_021073，NM_001442，NM_006614;
　　2.通過lncRNA與mRNA的共表達網(wǎng)絡分析，挑選出了ENST00000563144、TCONS_00014447、ENST00000528204共計3條在CS患者骨髓間充質(zhì)干細胞中存在差異性表達的，并在生物學功能方面可能與肌肉、骨骼發(fā)育相關的lncRNA。
　　結論:
　　1、本研究發(fā)現(xiàn)BMP5、CHL