長(zhǎng)鏈非編碼RNA在先天性脊柱側(cè)凸中的表達(dá)研究.pdf

1、先天性脊柱側(cè)凸(congenital scoliosis，CS)是脊柱側(cè)凸中的一個(gè)大類，約占全部脊柱側(cè)凸的5.19％[1]。CS定義為“由于胚胎期脊柱椎體發(fā)育異常而引起的脊柱畸形”。在先天性脊柱側(cè)凸患者中，絕大部分病情均呈現(xiàn)進(jìn)展性[2]。CS在新生兒的中的發(fā)病率約為0.5-1‰[3]。CS具有進(jìn)展快、畸形重等特點(diǎn)，治療以手術(shù)治療緩解病情為主，對(duì)家庭和社會(huì)都造成了極大的負(fù)擔(dān)。目前，CS的發(fā)病機(jī)制仍未明確，關(guān)于CS的發(fā)病機(jī)制有多種假說，主要

2、分為環(huán)境因素和易感基因兩類。但是目前現(xiàn)有的假說仍然無法很好的解釋CS的病因。
　　目前的研究表明部分的CS患者存在家族聚集現(xiàn)象，有家族遺傳傾向的約占3％，因此認(rèn)為CS以散發(fā)為主[4]。國(guó)內(nèi)外學(xué)者對(duì)先天性脊柱側(cè)凸的基因組學(xué)及蛋白質(zhì)組學(xué)方面進(jìn)行了大量的研究，也取得了不小的進(jìn)展，但是仍然無法很好的解釋CS完整的起病機(jī)制。長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNAs，lncRNAs)是指真核細(xì)胞中一類長(zhǎng)度超過200nt的，沒

3、有編碼蛋白功能的RNA分子[5]。近年來，lncRNAs逐漸受到了人們的關(guān)注，發(fā)現(xiàn)其在不少疾病的起病機(jī)制中都起到了重要的作用。研究中發(fā)現(xiàn)lncRNA的生物學(xué)作用非常復(fù)雜，通過多種機(jī)制調(diào)節(jié)了基因的表達(dá)過程。本研究運(yùn)用基因芯片技術(shù)在培養(yǎng)的骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞中挑選差異性lncRNA，希望從長(zhǎng)鏈非編碼RNA的研究中，對(duì)CS的發(fā)病機(jī)制能有一些新的認(rèn)知。
　　目的:
　　通過研究CS患者的骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞，運(yùn)用基因芯片技術(shù)挑選其中差異性表

4、達(dá)的lncRNA，研究其在轉(zhuǎn)錄組水平的差異性表達(dá)，探討CS可能的發(fā)病機(jī)制。
　　方法:
　　1.取5例先天性脊柱側(cè)凸患者以及5例年齡性別民族匹配的正常對(duì)照人群的骨髓，通過細(xì)胞培養(yǎng)得到骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞;
　　2.運(yùn)用Agilent4×44K全基因組芯片技術(shù)篩選出有表達(dá)差異的，并在功能方面可能對(duì)肌肉、骨骼系統(tǒng)發(fā)育有所影響的lncRNA。
　　結(jié)果:
　　1.通過基因芯片技術(shù)及Pathway分析、GO(Gene

5、ontology)分析后挑選出3個(gè)目標(biāo)mRNA，NM_021073，NM_001442，NM_006614;
　　2.通過lncRNA與mRNA的共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析，挑選出了ENST00000563144、TCONS_00014447、ENST00000528204共計(jì)3條在CS患者骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞中存在差異性表達(dá)的，并在生物學(xué)功能方面可能與肌肉、骨骼發(fā)育相關(guān)的lncRNA。
　　結(jié)論:
　　1、本研究發(fā)現(xiàn)BMP5、CHL