灰氈毛忍冬花管開裂相關基因ZFp-1全長克隆與表達分析.pdf

1、本文以灰氈毛忍冬花管為研究材料，在轉錄測序的基礎上，應用RT-PCR和RACE技術分離得到一個具有鋅指結構的基因ZFP-1，并對ZFP-1基因進行生物信息學分析、熒光定量表達等方面的研究分析，通過該基因在花器官發(fā)育不同時期的表達模式，推測該基因在花器官發(fā)育過程中起到調控作用，為灰氈毛忍冬花管開裂的分子調控機制進一步研究奠定了理論基礎，為灰氈毛忍冬分子育種提供理論基礎，本研究主要結果如下:
　　(1)通過RT-PCR和RACE技術分

2、離得到ZFP-1基因的全長cDNA序列，該基因全長1647bp，包括一個長度為1116bp的完整開放閱讀框（ORF），3'非編碼區(qū)長205bp、5'非編碼區(qū)長326bp，編碼371個氨基酸的蛋白質，在GenBank上登錄號為KR013240。與其它物種相比，核苷酸序列比對發(fā)現(xiàn)該序列與梅花、碧桃、可可、蘋果和柑橘的序列同源性分別為77％、77％、76％、76％和75％。
　　(2)灰氈毛忍冬ZFP-1基因蛋白屬于鋅指蛋白基因家族中的

3、一員，其N端具有一個115個左右氨基酸的BTB/POZ結構域，C端有一個zf-TAZ鋅指結構，與其它物種相比，氨基酸序列比對發(fā)現(xiàn)該序列與可可ZFP氨基酸序列同源性高達75％，與葡萄ZFP氨基酸序列同源性為74％。
　　(3)ZFP-1基因編碼的蛋白質推測其分子量為4.28kD，理論等電點為9.18。20種基本氨基酸全部都有出現(xiàn)，其中，非極性氨基酸占總氨基酸的46.1％，不帶電荷的極性氨基酸占總氨基酸的24.5％，帶正點（堿性）的氨

4、基酸占總氨基酸的18.1％，帶負點（酸性）氨基酸占總氨基酸的11.3％。整體上看，ZFP-1蛋白中極性氨基酸數(shù)量略高于非極性氨基酸的數(shù)量。由此可以推測，ZFP-1蛋白為親水性蛋白。
　　(4)ZFP-1基因編碼的蛋白質二級結構以卷曲和螺旋結構為主，在接近N端的位置存在一個跨膜結構，位于104～122氨基酸處，長度為19個氨基酸，另外還存在一個信號肽序列，位于1～70氨基酸處。
　　(5)qRT-PCR分析表明，ZFP-1基因