三種神經(jīng)退行性疾病相關基因互作網(wǎng)絡和藥物靶點的比較分析.pdf

1、神經(jīng)退行性疾病是一類以大腦和脊髓中特定的神經(jīng)元損傷或丟失為主要病理特征的疾病。根據(jù)神經(jīng)退行性疾病的病理表現(xiàn)可以分為的三種典型的神經(jīng)退行性疾病，分別是認知型、行動障礙型和炎型神經(jīng)退行性疾病，而阿爾茲海默癥(Alzheimer's disease，AD)、帕金森癥(Parkinson's Disease，PD)和多發(fā)性硬化(Multiple sclerosis，MS)則分別是這三類神經(jīng)退行性疾病的代表。雖然近年來這些疾病的研究已成為相關領域

2、的熱點，但這些不同類型的神經(jīng)退行性疾病到底有哪些內(nèi)在聯(lián)系？其發(fā)生發(fā)展的分子機制有哪些異同仍然不清楚。
　　鑒于此，本文通過文獻檢索和數(shù)據(jù)庫挖掘，分別篩選了125個AD相關的基因、288個PD相關的基因和185個MS相關的基因。通過對神經(jīng)退行性疾病相關基因的比較分析發(fā)現(xiàn)了9個在三個神經(jīng)退行性疾病共同的基因（分別為ACE_HUMAN、APOE_HUMAN、 ESR1_HUMAN、HFE_HUMAN、IL10_HUMAN、 IL8_HU

3、MAN、 MTHR_HUMAN、 PON1_HUMAN和TNFA_HUMAN）。隨后，通過對神經(jīng)退行性疾病相關基因的GO功能分析，發(fā)現(xiàn)共有37個GO terms在三種神經(jīng)退行性疾病中均顯著富集;其主要與活性氧的生物合成、細胞對生物刺激的反應、脂質(zhì)相關途徑、炎癥、衰老等功能相關。進而對目標基因所在的信號通路進行注釋（主要基于KEGG、Reactome、BioCyc、PANTHER幾大數(shù)據(jù)庫信息）和富集分析，發(fā)現(xiàn)了兩條在三種神經(jīng)退行性疾病中

4、均顯著富集的信號通路，分別為類風濕性關節(jié)炎(Rheumatoidarthritis，RA)和炎性腸病(Inflammatory bowel disease，IBD)，暗示這兩種疾病與神經(jīng)退行性疾病間存在聯(lián)系。然后，從網(wǎng)絡水平對三種疾病進行比較分析，找到了25個他們共同交叉的關鍵節(jié)點，為未來設計同時作用于三種疾病的藥物提供了有效的提示和數(shù)據(jù)信息。
　　最后，對已知針對3種神經(jīng)退行性疾病的藥物及其作用的靶標基因進行收集，結(jié)合PPI網(wǎng)絡