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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
本研究旨在探討T細(xì)胞轉(zhuǎn)錄因子TBX21、GATA3、Rorc和Foxp3基因遺傳變異(單核苷酸多態(tài)性、拷貝數(shù)變異)與中國(guó)漢族人群Behcet病和VKH綜合征遺傳易感性的相關(guān)性。
方法:
本研究采用兩階段關(guān)聯(lián)分析策略。SNP位點(diǎn)采用Sequenom方法和限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性聚合酶鏈反應(yīng)(PCR-RFLP)技術(shù)進(jìn)行分型。我們采用ABI7500實(shí)時(shí)熒光定量程序進(jìn)行樣本TBX21、GATA3、Rorc和Fo
2、xp3基因拷貝數(shù)檢測(cè)和mRNA表達(dá)水平檢測(cè),ELISA法檢測(cè)細(xì)胞因子水平。
結(jié)果:
高Rorc拷貝數(shù)(Rorc>2)與Behcet病易感性相關(guān)(P=8.99×10-8, OR=3.0,95%CI2.0-4.6)。在女性中,低Foxp3拷貝數(shù)(Foxp3<2)與Behcet病易感性相關(guān)(P=1.92×10-5,OR=3.1,95%CI1.8-5.2)。TBX21、GATA3、Rorc和Foxp3基因拷貝數(shù)變異與VKH綜
3、合征遺傳易感性無(wú)相關(guān)性。進(jìn)一步功能實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)高Rorc拷貝數(shù)(Rorc>2)的個(gè)體有Rorc mRNA的高表達(dá),結(jié)果具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=7.40×10-5)。但是在不同F(xiàn)oxp3基因拷貝數(shù)的個(gè)體之間,F(xiàn)oxp3 mRNA的表達(dá)無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。高Rorc拷貝數(shù)(Rorc>2)的個(gè)體比Rorc≤2的個(gè)體具有高表達(dá)的IL-1β和IL-6水平。本研究納入的25個(gè) SNP位點(diǎn)基因型和等位基因頻率在Behcet病患者和正常對(duì)照、VKH綜合征和正常對(duì)照之
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