Alu序列準周期模式的初步探討.pdf

1、本論文屬于生物信息學的研究范疇。對人類基因組來說，迄今為止，人們真正掌握規(guī)律的只有DNA上的編碼蛋白質的區(qū)域（基因），最新資料說明這部分序列約占基因組的3％。僅占人類基因組3％的編碼區(qū)的相關研究已經締造了數十位諾貝爾獎獲得者，97％非編碼區(qū)蘊含的生物信息量將是十分可觀的，因此尋找這些區(qū)域的編碼特征、信息調節(jié)與表達規(guī)律是未來相當長時間內的熱點課題。 在大多數真核生物的基因組中存在著大量的散置重復序列，Alu序列屬于中等重復的短散置

2、序列，約占人類基因組的5％～6％。最近研究表明Alu序列可能與調控網絡有關，調控散置在基因組中的基因協(xié)同表達。我們知道，基因中的DNA序列是通過三聯體編碼方式決定蛋白質序列，那么Alu序列是否具有類似于基因中的三聯體編碼的編碼性質呢？ 本文我們首先嘗試用準周期的方法在Alu序列中尋找可能的編碼方式，并與外顯子，內含子的分析結果進行對比，結果顯示Alu序列可能具有8聯體的編碼方式。同時Alu序列8聯體的編碼性質也支持了原來人們曾經

3、提出的Alu序列可能參與表達調控的觀點。 為了進一步研究Alu序列的準周期模式，我們分別對這些序列左右臂的準周期進行了統(tǒng)計分析，結果發(fā)現所有序列的右臂顯示出顯著的準周期8，而左臂則有5或者8的準周期特點；同時我們也發(fā)現左臂中的準周期5有向準周期8進化的趨勢。這些結果表明，在進化過程中，Alu序列有比較保守的準周期8，因而Alu序列可能具有一種或幾種特定的功能。 對于Alu各家族和各家族左右臂，我們分別統(tǒng)計了它們在每個周期