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文檔簡介
1、大片段基因組文庫是進行基因組研究、基因分離及其快速利用的一項重要的基礎性工作,特別是對于大基因組生物來說更是如此??赊D化人工染色體(Transformationcompetentartificialchromosome,TAC)載體含P1噬菌體和Ri質粒的復制子,因而能夠在大腸桿菌和農(nóng)桿菌中以單拷貝形式穿梭復制。一旦篩選到目標陽性克隆,可直接利用農(nóng)桿菌轉化系統(tǒng)將其轉到植物體中進行基因功能互補實驗,省去了亞克隆的步驟。 高質量的載
2、體DNA和高質量的大片段DNA是文庫構建的兩個基本要素,目前,已有文獻多側重于文庫的構建及利用和高質量的大片段DNA的獲得,對文庫載體DNA制備的研究則少見報道。本論文以TAC載體pYLTAC17和pYLTAC747H為材料,針對高質量載體DNA制備過程中的關鍵步驟,如質粒載體的分離和純化及檢測、HindⅢ內切酶最佳完全酶切條件選擇、HK脫磷酶最佳完全脫磷效果的載體自連檢測、載體DNA與lambdaDNA/HindⅢ連接能力的檢測及轉化
3、克隆分析等進行了研究。主要結果如下:用QIAprepSpinMiniprep試劑盒分離純化得到的載體pYLTAC17的濃度是300ng/ul,pYLTAC747H的濃度是400ng/ul;將所提純的兩種載體DNA電轉化到大腸桿菌DH10B感受態(tài)細胞中,復蘇培養(yǎng)液涂于LB+Kan25mg.L-1(+5%蔗糖)平板,計算每ul在含有蔗糖和沒有蔗糖的培養(yǎng)基上出現(xiàn)的菌落數(shù)的比例,分別是pYLTAC17為1:28885.7,pYLTAC747H為
4、1:119600,均遠小于1/5000,說明兩種載體DNA中的sacB基因均功能正常,可以繼續(xù)進行TAC文庫構建的后續(xù)步驟;對兩種閉環(huán)載體DNA分別用1U、2U、3U、5U和7U共5種不同梯度的HindⅢ酶切處理,電泳檢測得出最適HindⅢ完全酶切條件是3U/ug閉環(huán)載體DNA,37℃,酶切30min;對最適HindⅢ酶切條件得到的兩種線性載體DNA,分別用0.5MBU和1MBU共2種不同梯度的HK脫磷酶處理,經(jīng)電泳和載體連接產(chǎn)物電轉化
5、大腸桿菌DH10B感受態(tài)細胞兩個方面的檢測得出最佳HK脫磷酶完全脫磷條件是1MBU/ug線性載體DNA,30℃,脫磷1h;不同酶切、脫磷處理下所制備的兩種線性載體DNA與lambdaDNA/HindⅢ的連接產(chǎn)物經(jīng)電轉化大腸桿菌感受態(tài)細胞后涂布于LB+Kan25mg.L-1+5%蔗糖平板上進行培養(yǎng),發(fā)現(xiàn)每ug載體DNA經(jīng)3UHindⅢ完全酶切、1MBUHK完全脫磷后的轉化頻率最高,pYLTAC17為1.93×108,pYLTAC747H為
6、2.86×108;隨機挑取兩種載體的轉化子各5個進行檢測,發(fā)現(xiàn)均有不同大小的插入片段,說明所制備載體的連接能力較好;每ugpYLTAC747H載體DNA經(jīng)3UHindⅢ完全酶切、1MBUHK完全脫磷后,與lambdaDNA/HindⅢ的連接產(chǎn)物電轉化大腸桿菌ElectroTen-Blue感受態(tài)細胞,復蘇培養(yǎng)液涂布于pH7.0的LB+12.5mg.L-1潮霉素+5%蔗糖平板上進行培養(yǎng),初步看出比電轉化大腸桿菌DH10B感受態(tài)細胞的轉化效率
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