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文檔簡介
1、wg/Wnt信號在心臟發(fā)育和心臟衰老過程中發(fā)揮重要的作用。pygo作為Wnt信號途徑的一個新成員,依賴于Wnt信號調(diào)控心臟發(fā)育。本研究室的最新結(jié)果表明,敲低pygo表達導(dǎo)致嚴重的成體心臟功能突變表型,而敲低Wnt/β-catenen-TCF信號成員的表達導(dǎo)致的突變表型,明顯低于pygo的表型水平或無表型。另一方面,TCF的顯性負突變引起與pygo表型一致的嚴重成體心臟生理功能缺陷,提示pygo調(diào)控成體心臟功能不依賴于經(jīng)典Wnt信號,可能
2、依賴與TCF類似因子相互作用而發(fā)揮功能,存在新的調(diào)控機制。因此,利用果蠅心衰模型,探究新型的pygo分子調(diào)控途徑成為了我們的研究重點。
為了探究pygo在果蠅成體心臟中的分子調(diào)控機制,本文采用了染色質(zhì)免疫共沉淀結(jié)合高通量測序(CHIP-seq)的方法鑒定pygo基因調(diào)控成體心臟功能的新靶點,首先,運用成體心臟功能分析系統(tǒng)驗證了pygo在維持成體心臟功能中的重要功能。其次通過果蠅雜交實驗構(gòu)建了心臟特異性(hand4.2 Gal4
3、)驅(qū)動UAS-HA-pygo過表達標簽穩(wěn)定系,采用免疫熒光實驗方法證明了HA抗體的有效性,檢測到Pygo蛋白在心管的表達。同時,剝?nèi)∵^表達果蠅品系心管,用甲醛交聯(lián),并用超聲波將其打斷成一定長度的小片段,取一部分染色質(zhì)作為Input,其余分別加特異性HA抗體,以及陰性對照IgG抗體,解交聯(lián),純化DNA,最后對文庫DNA進行驗證、質(zhì)檢、高通量測序。測序后對結(jié)果進行多方面處理,去污染及接頭、將測序轉(zhuǎn)化為可視化數(shù)據(jù);通過MACS方法追蹤到799
4、個重要基因組特征峰值,并對其基因結(jié)構(gòu)進行了分類,使用最新的UCSC瀏覽器對數(shù)據(jù)進行結(jié)構(gòu)和功能注釋;對峰值信號進行GO富集聚類分析,Pygo相互作用基因的功能主要定位在染色體結(jié)構(gòu)變化和修飾過程中;分析轉(zhuǎn)錄起始位點TSS附近的峰值分布特征并對三個重復(fù)樣品進行啟動子峰值交叉分析,找到120多個代表基因;并對三個重復(fù)樣品進行信號通路分析,定位到11條重要的信號通路。通過綜合分析我們初步定位到26個Pygo蛋白可能調(diào)控的候選基因。目前,候選基因的
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