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文檔簡(jiǎn)介
1、本文對(duì)miRNAs、MTHFR基因多態(tài)性與中國(guó)漢族人群缺血性腦卒中的關(guān)聯(lián)性進(jìn)行了研究。本研究分為兩個(gè)部分:
第一部分:miRNAs、MTHFR基因多態(tài)性與中國(guó)漢族人群缺血性腦卒中的關(guān)聯(lián)研究。
目的:缺血性腦卒中(Ischemic stroke,IS)是一類由基因和環(huán)境因素共同作用而導(dǎo)致的復(fù)雜性疾病。MicroRNAs(miRNAs)和亞甲基四氫葉酸還原酶(methylenetetrahydro-folate redu
2、ctase,MTHFR)在缺血性腦卒中的發(fā)生和發(fā)展中起到重要作用。MicroRNAs和MTHFR基因單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)與人類很多疾病易感性有關(guān)。近年的研究表明,miR-146a C>G(rs2910164)、miR-196a2 T>C(rs11614913)、miR-499 A>G(rs3746444)和miR-149T>C(rs2292832)已經(jīng)被發(fā)現(xiàn)與多種疾病
3、發(fā)病易感性有關(guān);然而,它們對(duì)缺血性腦卒中發(fā)病易感性影響的研究報(bào)道很少,與亞型關(guān)聯(lián)研究更少,且結(jié)果不一。MTHFR3’-非翻譯區(qū)(3’-untranslated region,3’-UTR)SNPs能夠改變基因表達(dá),影響與miRNAs結(jié)合,增加疾病發(fā)生風(fēng)險(xiǎn),而其3’-UTR(rs4846049) G>T多態(tài)性與缺血性腦卒中的關(guān)聯(lián)及其與miRNAs基因-基因交互作用,目前尚未檢索到相關(guān)報(bào)道。本研究探討miRNAs、MTHFR基因多態(tài)性與中國(guó)
4、漢族人群缺血性腦卒中的關(guān)聯(lián)性。
方法:本研究采用病例-對(duì)照設(shè)計(jì),隨機(jī)選取符合研究標(biāo)準(zhǔn)的396名缺血性腦卒中病人為病例組,對(duì)照組為378名健康人群。按照TOAST分型標(biāo)準(zhǔn)分為:大動(dòng)脈粥樣硬化型(1arge artery atherosclerosis,LAA)和小動(dòng)脈閉塞型(small artery occlusion,SAO),進(jìn)行亞組分析。采用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長(zhǎng)度多態(tài)性(Polymerase chain reacti
5、on-Restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)和直接測(cè)序法對(duì)miR-146a C>G(rs2910164)、miR-196a2 T>C(rs11614913)、miR-499A>G(rs3746444)、miR-149T>C(rs2292832)和MTHFRG>T(rs4846049)五個(gè)SNPs在病例組及對(duì)照組進(jìn)行基因分型分析。采用擬合優(yōu)度卡方檢驗(yàn)分析Hardy-Weinbe
6、rg遺傳平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE);采用logistic回歸模型分析SNPS及其與傳統(tǒng)危險(xiǎn)因素(吸煙、飲酒、糖尿病、高血壓?。┙换プ饔脤?duì)缺血性腦卒中的影響;采用多因子降維法(multifactor dimensionality reduction,MDR)分析基因-基因交互作用對(duì)缺血性腦卒中的影響;采用廣義線性模型分析與缺血性腦卒中相關(guān)SNPs對(duì)血脂的影響。
結(jié)果:⑴所有研究對(duì)象每個(gè)S
7、NP位點(diǎn)基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),表示所選取樣本具有人群代表性,適合行遺傳學(xué)分析。⑵miR-146 a C>G(rs2910164) GG基因型可顯著增加缺血性腦卒中發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.86,95% CI:1.19-2.88,P=0.006);顯性模型示:CG+GG基因型較CC基因型可增加39%的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.39,95% CI:1.04-1.86,P=0.027);隱性模型示:GG基因型較
8、CC+CG基因型可增加62%的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.62,95% CI:1.08-2.42,P=0.020);加性模型示:每增加1個(gè)G等位基因,其發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)增加34%(OR=1.34,95% CI:1.09-1.65,P=0.006);與C等位基因相比,G等位基因可顯著增加缺血性腦卒中發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.33,95% CI:1.09-1.64,P=0.006)。亞組分析示,rs2910164 C>G可顯著增加LAA型發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(P<0.05)
9、,僅在校正傳統(tǒng)危險(xiǎn)因素后,GG基因型可增加SAO型發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(P<0.05)。⑶miR-149 T>C(rs2292832)CC基因型可顯著增加缺血性腦卒中的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=2.00,95% CI:1.22-3.28,P=0.006);顯性模型示:TC+CC基因型較TT基因型可顯著增加42%的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.42,95% CI:1.07-1.88,P=0.017);隱性模型示:CC基因型較TT+TC基因型可增加75%的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=
10、1.75,95% CI:1.09-2.82,P=0.020);加性模型示:每增加1個(gè)C等位基因,其發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)增加37%(OR=1.37,95% CI:1.11-1.7,P=0.004);與T等位基因相比,C等位基因可顯著增加缺血性腦卒中發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.37,95% CI:1.11-1.7,P=0.004)。亞組分析示,rs2292832 T>C可顯著增加LAA型發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(P<0.05),未發(fā)現(xiàn)與SAO型發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)顯著相關(guān)性(P>0.05
11、)。⑷MTHFR G>T(rs4846049)TT基因型可顯著增加缺血性腦卒中發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=2.87,95% CI:1.43-5.76,P=0.003);顯性模型示:GT+TT基因型攜帶者發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)是GG基因型的1.71倍(OR=1.71,95% CI:1.28-2.28,P<0.001);隱性模型示:TT基因型攜帶者發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)是GG+GT基因型的2.41倍(OR=2.41,95% CI:1.21-4.8,P=0.012);加性模型示:每
12、增加一個(gè)T等位基因,其發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)增加63%(OR=1.63,95% CI:1.28-2.08,P<0.001);與G等位基因相比,T等位基因可顯著其發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(OR=1.62,95% CI:1.28-2.06,P<0.001)。亞組分析示,rs4846049 G>T可顯著增加LAA型發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(P<0.05);也可增加SAO型發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)(P<0.05),但校正傳統(tǒng)危險(xiǎn)因素后,未達(dá)到顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。⑸未發(fā)現(xiàn)miR-196a2 T>
13、C(rs11614913)和miR-499 A>G(rs3746444)多態(tài)性與缺血性腦卒中發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)有顯著相關(guān)性(P>0.05);亞組分析也未發(fā)現(xiàn)兩基因位點(diǎn)多態(tài)性與LAA型和SAO型缺血性腦卒中的發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)有顯著關(guān)聯(lián)性(P>0.05)。⑹未發(fā)現(xiàn)miR-146a C>G(rs2910164)、miR-149 T>C(rs2292832)和MTHFRG>T(rs4846049)與吸煙、飲酒、高血壓病、糖尿病危險(xiǎn)因素交互作用有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P
14、>0.05)。⑺miR-196a2 T>C(rs11614913)、miR-499 A>G(rs3746444)和MTHFRG>T(rs4846049)有基因-基因交互作用(P<0.05)。⑻miR-149 T>C(rs2292832)和MTHFRG>T(rs4846049)與總膽固醇水平升高顯著相關(guān)(P<0.05),未發(fā)現(xiàn)miR-146a C>G(rs2910164)多態(tài)性位點(diǎn)與血脂水平有顯著關(guān)聯(lián)性(P>0.05)。
結(jié)論:
15、①miR-146aC>G(rs2910164)和miR-149 T>C(rs2292832)多態(tài)性可能與中國(guó)漢族人群缺血性腦卒中發(fā)病易感性增加有關(guān);其多態(tài)性可能主要增加LAA型缺血性腦卒中發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)。②發(fā)現(xiàn)MTHFR G>T(rs4846049)多態(tài)性可能與中國(guó)漢族人群缺血性腦卒中發(fā)病易感性增加有關(guān),可能主要增加LAA型缺血性腦卒中發(fā)病易感性。③miR-196a2T>C(rs11614913)和miR-499 A>G(rs3746444)
16、多態(tài)性可能與中國(guó)漢族人群缺血性腦卒中發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)無(wú)相關(guān)性。④miR-146a C>G(rs2910164)、miR-149T>C(rs2292832)和MTHFRG>T(rs4846049)多態(tài)性影響中國(guó)人群缺血性腦卒中的發(fā)病易感性,可能不是通過(guò)與吸煙、飲酒、高血壓病、糖尿病存在交互作用所致。⑤miR-196a2 T>C(rs11614913)、miR-499 A>G(rs3746444)和MTHFRG>T(rs4846049)之間可能存在
17、基因-基因交互作用,影響中國(guó)漢族人群缺血性腦卒中的發(fā)病易感性。⑥miR-149 T>C(rs2292832)和MTHFRG>T(rs4846049)多態(tài)性增加中國(guó)漢族人群缺血性腦卒中發(fā)病風(fēng)險(xiǎn),可能與影響血脂代謝水平有關(guān)。
第二部分:MTHFR基因 C677T多態(tài)性與中國(guó)人群缺血性腦卒中風(fēng)險(xiǎn):匯總分析。
目的:亞甲基四氫葉酸還原酶(methylenetetrahydrofolate reductase,MTHFR)基因
18、C677T多態(tài)性與缺血性腦卒中之間的關(guān)系已被廣泛研究;然而,在不同的人群中結(jié)果是不一致的,特別是在中國(guó)人群中。綜合評(píng)價(jià)MTHFR基因C677T多態(tài)性與缺血性腦卒中之間關(guān)聯(lián)性是非常有必要的。因此,我們的研究目的是進(jìn)一步去評(píng)估MTHFR基因C677T多態(tài)性與中國(guó)人群缺血性腦卒中發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性。
方法:從Pubmed、OVID、Embase、萬(wàn)方數(shù)據(jù)庫(kù)、中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù)(CNKI)、重慶維普數(shù)據(jù)庫(kù)(VIP)和中國(guó)生物醫(yī)學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)
19、庫(kù)(CBM),收集了所有截至到2014年8月的相關(guān)研究。匯總分析采用Stata12.0統(tǒng)計(jì)軟件,利用OR及其95% CI評(píng)價(jià)基因多態(tài)性與缺血性腦卒中的關(guān)聯(lián)強(qiáng)度,采用Q-檢驗(yàn)和I2檢驗(yàn)評(píng)價(jià)各文獻(xiàn)之間異質(zhì)性。采用不同的基因效應(yīng)模型、亞組分析、發(fā)表偏倚和敏感性分析,來(lái)提高分析結(jié)果的可靠性。
結(jié)果:匯總分析結(jié)果顯示,MTHFR基因C677T多態(tài)性在總?cè)巳毫鶄€(gè)基因模型均存在顯著關(guān)聯(lián)性(加性模型: OR=1.34,95% CI:1.17-
20、1.54,P<0.001;顯性模型: OR=1.44,95% CI:1.26-1.64,P<0.001;隱性模型: OR=1.45,95% CI:1.15-1.83,P=0.001;雜合子模型:OR=1.35,95%CI:1.18-1.55,P<0.001;純合子模型: OR=1.80,95% CI:1.34-2.41,P<0.001;等位基因模型:OR=1.34,95% CI:1.17-1.53,P<0.001);亞組分析中也得到同樣
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