長爪沙鼠微衛(wèi)星DNA、RAPD位點篩選和群體遺傳結構分析.pdf

1、長爪沙鼠在生命科學諸多領域己得到廣泛應用，是一種正在被國內外開發(fā)的“多功能性”實驗動物，但有關長爪沙鼠的遺傳研究甚少，其群體遺傳結構尚不清楚。因此，開展長爪沙鼠基因多樣性研究將有助于了解其基因結構和群體遺傳狀態(tài)，為長爪沙鼠的保種、性狀控制和生產管理提供依據，促進長爪沙鼠實驗動物化和標準化進程。實驗通過PCR擴增技術從長爪沙鼠近緣動物大、小鼠不同染色體上的62個微衛(wèi)星位點中篩選長爪沙鼠微衛(wèi)星位點，并從隨機合成的50條RAPD引物中篩選適用

2、于長爪沙鼠的RAPD位點。用試驗篩選出的8個微衛(wèi)星位點和GenBank中的5個有效位點以及20條適合于長爪沙鼠群體遺傳分析的RAPD位點對國內2個主要的長爪沙鼠生產單位的4個群體(北京首都醫(yī)科大學實驗動物科學部B1和B2,浙江省實驗動物中心的Z1和Z2)進行遺傳分析。結果表明，13個微衛(wèi)星位點在沙鼠群體中等位基因數在1～4之間，等位基因數平均為2.1538個；有效等位基因數在1.0000～2.2688之間，平均有效等位基因數為1.598

3、6；二者的平均值相差較小，各群體內微衛(wèi)星標記的等位基因頻率分布均勻。20個RAPD引物共擴增出了108條清晰穩(wěn)定的譜帶，其中有18個引物的擴增帶具有多態(tài)性；擴增產物的片段長度在200～2000bp之間，單一引物擴增條帶為2～9條。經微衛(wèi)星DNA和RAPD分析結果表明，4個群體均符合Hardy-Weinberg平衡狀態(tài)；4個群體的微衛(wèi)星位點的基因純合度偏高(0.5027～0.6044)；4個沙鼠群體微衛(wèi)星位點的平均雜合度偏低(0.3956

4、～0.4973)；微衛(wèi)星和RAPD的Nei's基因多樣性指數和香隆指數(Shannon's)都偏低。4個群體的聚類分析表明，北京的兩個群體的遺傳距離相對較遠，而浙江兩個群體相對較近，但經統(tǒng)計結果表明，4個群體之間只有B1與Z2群體差異顯著。 通過以上結果說明：本實驗建立了由大、小鼠微衛(wèi)星位點中選取長爪沙鼠微衛(wèi)星位點的方法，并成功篩選出8個長爪沙鼠微衛(wèi)星位點；篩選出了可有效進行長爪沙鼠群體遺傳分析的13個微衛(wèi)星位點和20個RAPD