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文檔簡介
1、轉座子是基因組上的一段一定長度的DNA序列,能在自身編碼的轉座酶或逆轉錄酶的作用下,發(fā)生自我剪切或復制,并且在基因組DNA中移動位置的基本單位。如青鳉Tol2轉座子(TransposableelememofOryziaslatipes,number2)和鮭魚SB轉座子(SleepingBeautyTransposon)都以“剪切-粘貼”的方式進行轉座,即轉座酶對轉座子進行剪切,然后介導其插入到基因組內(nèi)部。研究證明Tol2轉座酶識別的是轉
2、座子末端反向重復序列和亞末端重復序列,當上述區(qū)域突變之后,其轉座效率會明顯下降。SB轉座酶識別的末端重復序列大約長230bp,由外側的反向重復序列(invertedrepeats,IR)和內(nèi)側的同向重復序列(directlyrepeats,DR)及兩者間的序列組成。根據(jù)它們的轉座機制,國外學者構建了基于Tol2和SB轉座子的轉基因系統(tǒng),即轉基因供體質(zhì)粒加轉座酶輔助質(zhì)粒的轉基因體系。研究表明,兩個轉基因系統(tǒng)都具有廣泛的通用性,近幾年已在轉
3、基因、基因捕獲和基因治療研究中取得了重大進展。
2008年,本實驗室在19種不同魚類物種或品系中進行PCR篩選,最后在我國金魚品系中發(fā)現(xiàn)了一個新的hAT家族轉座子,命名為金魚Tgf2轉座子。在此基礎上,本研究進一步采用cDNA末端快速擴增法(RACE)克隆了Tgf2轉座酶全長cDNA,并對其表達進行了RT-PCR和原位雜交研究;其后,對Tgf2轉座子的多態(tài)性進行了研究;最后,利用Tgf2轉座子的左右末端和轉座酶編碼框(CD
4、S)構建了具有自主知識產(chǎn)權的轉基因系統(tǒng),并在斑馬魚、草魚、金魚和鯽魚等鯉科魚類中開展了轉基因研究。主要研究結果如下:
1.Tgf2轉座酶全長cDNA的克?。汗部寺〉玫?種轉錄本,分別命名為gfTP-1、gfTP-2、gfTP-3、gfTP-4、gfTP-5、gfTP-6、gfTP-7;經(jīng)對其編碼框進行預測,發(fā)現(xiàn)金魚Tgf2轉座子能編碼產(chǎn)生3種長度的轉座酶,其編碼框長度分別為:2061bp(gfTP-1)、1953bp(gf
5、TP-2和gfTP-3)和1734bp(gfTP-4、gfTP-5、gfTP-6和gfTP-7),分別編碼686個、650個和577個氨基酸殘基;金魚Tgf23種長度的轉座酶間的差異主要體現(xiàn)在5’端,與青鳉Tol2的3種轉座酶序列相比較,發(fā)現(xiàn)兩種魚類的轉座酶在序列上的相似度達99%,僅有7個氨基酸的差異。
2.選取3種長度金魚Tgf2轉座酶mRNA的共有區(qū)設計引物,對金魚不同組織總RNA進行RT-PCR分析,結果顯示Tgf
6、2轉座酶基因在金魚所有組織均有表達,以卵巢中表達量最高,其次為肝臟。對金魚不同發(fā)育時期胚胎進行RT-PCR和整胚原位雜交分析,結果表明轉座酶基因的表達模式在不同個體問具有明顯時空差異。
3.對珍珠、鶴頂紅、紅獅頭、花獅頭、琉金、蝶尾、龍睛、水泡眼和草金9個不同金魚品系的基因組進行PCR分析,發(fā)現(xiàn)Tgf2轉座子在金魚各品系中均有分布;并揭示了在金魚基因組中,Tgf2轉座子既有完整拷貝也有包含缺失的拷貝。
4.克
7、隆了Tgf2轉座子的220bp左末端和185bp右末端序列,并以此構建了基于Tgf2轉座子的pTgf2-eflα-eGFP、pTgf2-krt8-eGFP和pTgf2-eflα-RFP轉基因供體質(zhì)粒;同時,利用Tgf2轉座酶1734bp的編碼區(qū)(編碼577個氨基酸殘基)構建了轉座酶輔助質(zhì)粒pCS2-gfTP。利用上述構建的轉基因供體質(zhì)粒和輔助質(zhì)粒系統(tǒng),在模式生物斑馬魚和常見養(yǎng)殖鯉科魚類草魚、鯽魚及金魚中進行了轉基因研究。結果表明:Tgf
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