透明細(xì)胞腎細(xì)胞癌長(zhǎng)鏈非編碼RNA表達(dá)譜分析及初步驗(yàn)證.pdf

1、目的:探討及分析透明細(xì)胞腎細(xì)胞癌（ccRCC）特異性長(zhǎng)鏈非編碼RNA（lncRNA）在腎癌及癌旁組織中的表達(dá)差異，以及可能的分子機(jī)制，篩選出有差異表達(dá)的lncRNA基因，初步驗(yàn)證并建立可靠的ccRCC的lncRNA表達(dá)譜。
　　方法：利用高通量lncRNA芯片技術(shù)分別檢測(cè)3例ccRCC組織及對(duì)應(yīng)癌旁組織中l(wèi)ncRNA表達(dá)譜的差異，對(duì)芯片結(jié)果進(jìn)行基因本體論（Gene Ontology），通路（Pathway）分析，建立lncRNA與

2、靶基因的基因網(wǎng)絡(luò)圖，并利用實(shí)時(shí)熒光定量RT-PCR技術(shù)對(duì)87例ccRCC患者組織標(biāo)本水平進(jìn)行微陣列檢測(cè)結(jié)果的驗(yàn)證。應(yīng)用 Pearson相關(guān)性分析 lncRNA的水平與 ccRCC轉(zhuǎn)移顯著相關(guān)性。Kaplan-Meier生存分析法用于生存時(shí)間相關(guān)性。
　　結(jié)果： ccRCC患者癌組織與癌旁對(duì)照樣本間差異表達(dá)的lncRNA共3862個(gè)，其中1619個(gè)上調(diào)表達(dá)，2243個(gè)下調(diào)表達(dá)（差異表達(dá)倍數(shù)≥2.0, p<0.05）。其中表達(dá)差異最穩(wěn)

3、定且變化倍數(shù)最大的6個(gè) IncRNA分子分別是：上調(diào)基因 LINC00944， AC011196.3，SNHG12；下調(diào)基因LINC01020，NPSR1-AS1，NONHSAT123350。實(shí)時(shí)熒光定量qRT-PCR結(jié)果顯示，該研究篩選出的6個(gè)lncRNA在87例ccRCC樣本中的表達(dá)差異與芯片檢測(cè)結(jié)果一致。Pearson相關(guān)性分析發(fā)現(xiàn)僅 NONHSAT123350的水平與 ccRCC轉(zhuǎn)移顯著相關(guān)（r=0.92， P=0.0101），

4、而與患者性別、年齡等因素?zé)o關(guān)。未發(fā)生轉(zhuǎn)移的腎透明細(xì)胞癌患者中NONHSAT123350高表達(dá)組占26％，低表達(dá)占74%。生存分析結(jié)果顯示，相對(duì)于低表達(dá)組，高表達(dá)組術(shù)后生存時(shí)間更長(zhǎng)，兩組術(shù)后中位生存時(shí)間分別是17.6個(gè)月（95% CI,13.6~21.3）和26.9個(gè)月（95%CI,23.2~30.1），差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義（P=0.0015）。
　　結(jié)論：在透明細(xì)胞腎細(xì)胞癌ccRCC組織與癌旁組織中存在大量差異表達(dá)的1ncRNA與