淫羊藿苷誘導人牙周膜干細胞成骨分化的長鏈非編碼RNA表達譜分析.pdf

1、目的：長鏈非編碼RNA（Long non-coding RNA。lncRNA）是核苷酸序列大于200nt，不編碼蛋白的新型RNA分子。有學者認為，lncRNA在調(diào)控細胞生長發(fā)育的過程中發(fā)揮著重要的作用，尤其對于干細胞增值和分化的調(diào)節(jié)。通過分析lncRNA在淫羊藿苷（Icariin。ICA）誘導人牙周膜干細胞（Human periodontal ligament stem cells。hPDLSCs）成骨分化前后的差異性表達，篩選出與成骨

2、分化密切相關的lncRNA，初步探討其功能和意義，為PDLSCs成骨分化的功能和機制研究奠定了基礎。
　　方法：（1）采用lncRNA表達譜芯片檢測ICA誘導hPDLSCs成骨分化前后的表達差異，篩選出差異表達2倍以上，P<0.05的mRNAs和lncRNAs；（2）生物信息學方法分析差異表達分子，預測成骨相關lncRNA的靶基因；（3） qRT-PCR驗證lncRNA表達譜芯片結果，檢測差異基因的表達水平；（4）結合生物信息學分

3、析，qRT-PCR結果以及查閱相關文獻，初步篩選成骨相關lncRNA。
　　結果：（1）采用lncRNA芯片，篩選出差異表達水平2倍以上，P<0.05的lncRNAs共48個，mRNAs共117個；（2）通過生物信息學分析，得到差異基因功能富集情況，每個信號通路上差異表達基因富集程度以及差異mRNAs和lncRNAs的共表達網(wǎng)絡；（3）qRT-PCR驗證了6個分子的表達水平，其趨勢與芯片結果基本一致；（4）最終選擇lncRNA-p