長(zhǎng)鏈非編碼RNA(lncRNA)在穩(wěn)定性心絞痛中的表達(dá)譜分析.pdf

1、目的:本課題利用基因芯片及生物信息學(xué)技術(shù)，探索穩(wěn)定性心絞痛(stable angina pectoris, SAP)長(zhǎng)鏈非編碼 RNA（long non-coding RNA，lncRNA)表達(dá)譜，篩選穩(wěn)定性心絞痛特異性lncRNA，初步探索差異表達(dá)lncRNA可能生物功能的初步信息，發(fā)現(xiàn)新的冠心病診斷的分子標(biāo)記物。
　　方法：選擇穩(wěn)定性心絞痛患者及健康人群（non-SAP）各5例，抽取各自血液樣本，分別提取RNA后，利用基因芯片

2、對(duì)lncRNA和微小RNA（MicroRNA，mRNA）進(jìn)行表達(dá)分析。采用散點(diǎn)圖、火山圖、聚類分析等方法，建立穩(wěn)定型心絞痛相關(guān)lncRNA及mRNA差異表達(dá)譜。根據(jù)FC(abc)值＞2， P＜0.05，初步篩選特異高表達(dá)lncRNA。利用生物信息學(xué)方法對(duì)差異表達(dá)的lncRNA。與 mRNA進(jìn)行聯(lián)合分析。具體包括：KEGG Orthology Based Annotation System（KOBAS）分析和Gene Ontology（G

3、O）分析；lncRNA-mRNA關(guān)聯(lián)分析。預(yù)測(cè)差異表達(dá)的1ncRNA可能參與的生物功能。
　　結(jié)果：分別將SAP的1ncRNA和mRNA的表達(dá)量與non-SAP比較。 LncRNAs及mRNA表達(dá)譜差異表達(dá)基因分別為22154條和25138條；SAP組根據(jù) FC（abc）值＞2，P＜0.05標(biāo)準(zhǔn)篩選后，lncRNA共有399條，其中上調(diào)226條，下調(diào)173條。同樣標(biāo)準(zhǔn)篩選，mRNA共有458條，其中上調(diào)347條，下調(diào)111條。GO

4、功能富集包含分子代謝（能量、鋅離子代謝等）、網(wǎng)格蛋白泡膜、腫瘤壞死因子反應(yīng)性、氧化應(yīng)激傳導(dǎo)、負(fù)向調(diào)控組蛋白等相關(guān)功能；信號(hào)通路富集包含EGF受體調(diào)控、DAG及IP3調(diào)控、HSF1激活、生理節(jié)律、蛋白羧化，運(yùn)送及分裂、Akt激活PI3K等相關(guān)通路；著富集到的疾病包含代謝性疾病、高血壓、動(dòng)脈相關(guān)疾病、鈣離子阻滯相關(guān)疾病、認(rèn)知功能減退等相關(guān)疾病。
　　結(jié)論：在穩(wěn)定性心絞痛中，lncRNA和 mRNA有大量表達(dá)顯著上調(diào)或下調(diào)，提示很大程度