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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:
1.基于席夫堿(PAS)的原理,合成了一系列具有熒光的酰肼類化合物。這些熒光化合物通過(guò)分子結(jié)構(gòu)上的肼基官能團(tuán),可特異性地檢測(cè)混合蛋白中的糖蛋白。
2.在糖蛋白檢測(cè)領(lǐng)域現(xiàn)有的基礎(chǔ)上,進(jìn)一步的提高檢測(cè)靈敏度,縮短檢測(cè)時(shí)間,降低檢測(cè)成本。開(kāi)發(fā)一種更加優(yōu)良、穩(wěn)定和實(shí)用的糖蛋白專屬檢測(cè)方法,更好地服務(wù)于糖蛋白組學(xué)領(lǐng)域的研究人員。
方法:
1.根據(jù)有機(jī)化學(xué)理論和文獻(xiàn)的指導(dǎo),含醛基的化合物在常溫下極易與
2、含肼基的化合物發(fā)生反應(yīng),生成相應(yīng)的腙、亞胺、酰胺脲等化合物。我們以含有苯環(huán)共軛的醛類為熒光母核,通過(guò)與含有兩個(gè)酰肼基的肼類化合物的一端酰肼基反應(yīng)得到目標(biāo)探針,再通過(guò)目標(biāo)探針的另一端酰肼基特異性地結(jié)合糖蛋白上氧化后的糖鏈,從而達(dá)到特異性地檢測(cè)糖蛋白的目的。在這一過(guò)程中,我們首先需要考察該探針的母核結(jié)構(gòu)與蛋白質(zhì)的有無(wú)特異性結(jié)合。如果沒(méi)有結(jié)合,說(shuō)明該探針不會(huì)通過(guò)其它結(jié)構(gòu)去結(jié)合蛋白質(zhì),從而極有可能通過(guò)一端的酰肼基特異性地去檢測(cè)糖蛋白,因此可作為
3、備選的熒光探針。
2.在備選染料的熒光探針中,選取產(chǎn)率高、熒光強(qiáng)、毒性低、成本較低的熒光探針進(jìn)行下一步考察。
3.我們分別通過(guò)對(duì)混合的標(biāo)準(zhǔn)蛋白(同時(shí)含糖蛋白和非糖蛋白)以及分別從人血清、人成纖維細(xì)胞、小鼠心肌組織、小鼠肝臟組織提取的總蛋白樣品來(lái)共同考察這種新建立的糖蛋白檢測(cè)技術(shù)。
4.首先,樣品總蛋白經(jīng)過(guò)十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰氨凝膠電泳(SDS-PAGE)分離;分離后的凝膠置于一定比例的醇酸溶液中固定,用
4、于除去影響下一步氧化效率的殘留電泳液成分。
5.糖蛋白檢測(cè)大多數(shù)是根據(jù)經(jīng)典席夫堿的原理,首先加入氧化劑夠高效地將蛋白質(zhì)上糖基的鄰二羥基氧化成鄰二醛基,再與含氨基、肼基或腙基的熒光探針結(jié)合。我們選用了多種常用的氧化劑,然后根據(jù)實(shí)驗(yàn)的需求從中篩選出具有水溶性好、毒性較低、氧化效率高,作用溫和的氧化劑進(jìn)行下一步實(shí)驗(yàn),通過(guò)檢測(cè)結(jié)果確定最佳的氧化條件。
6.實(shí)驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn)殘留的氧化劑對(duì)檢測(cè)結(jié)果影響非常之大,為了去除殘留的氧化劑,
5、我們需要篩選一種有效的且不會(huì)影響后續(xù)檢測(cè)的還原劑。在選用的常用的還原劑中,根據(jù)實(shí)驗(yàn)的需求從中篩選出具有水溶性好、毒性較低、干擾少,進(jìn)一步通過(guò)檢測(cè)結(jié)果確定最佳的還原條件。
7.樣品處理完畢后,接著加入新合成的探針進(jìn)行染色。該過(guò)程仍需篩選探針的溶劑外環(huán)境、染色濃度、染色時(shí)間,最終確定其最佳著色條件。
8.經(jīng)熒光探針染色后的凝膠上的糖蛋白,需要置于凝膠成像儀內(nèi)成像,收集熒光信號(hào)。
9.最后,采用糖蛋白的去糖基化酶
6、(PNGase F)的去糖基化實(shí)驗(yàn)、凝集素富集實(shí)驗(yàn)、LC-MS/MS質(zhì)譜實(shí)驗(yàn),同時(shí)與其他使用的糖蛋白檢測(cè)試劑盒進(jìn)行對(duì)比,共同來(lái)考察這種新方法術(shù)的選擇性、靈敏度和有效性。
結(jié)果:
1.從一系列合成的酰肼類熒光探針中,發(fā)現(xiàn)1-芘基碳酰肼(UGF202),其在熒光、成本和檢測(cè)特異性方面均優(yōu)于其他備選染料。
2.從雙氧水、高錳酸鉀、重鉻酸鉀、高碘酸(HIO4)等常用的氧化劑中,最終選擇了高碘酸作為氧化劑并篩選出了最
7、佳氧化條件。在室溫條件下,高碘酸以較低的濃度在20分鐘內(nèi)將糖蛋白上的糖鏈部分高效率地開(kāi)環(huán)氧化成鄰二醛基,又可避免過(guò)度氧化。
3.從常用的還原劑中,如硼酸氫鈉、亞硫酸氫鈉、抗壞血酸(VC),確定了抗壞血酸作為最佳還原劑,其優(yōu)點(diǎn)在于僅需5分鐘即可中和凝膠上殘留的高碘酸,而不會(huì)影響下一步熒光探針跟糖蛋白質(zhì)的共價(jià)結(jié)合,又能通過(guò)抗壞血酸的顏色變化來(lái)判斷高碘酸的去除情況。
4.總結(jié)以上的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,這種新建立的糖蛋白特異性檢測(cè)方法
8、的操作步驟如下:
(1)經(jīng)SDS-PAGE分離后,凝膠置于50%甲醇(MeOH)5%無(wú)水醋酸(HAc)的固定液中固定20分鐘;
(2)棄去固定液,加入1%高碘酸(HIO4)的水溶液氧化20分鐘;
(3)棄去氧化液,加入1%抗壞血酸(VC)水溶液還原5分鐘;
(4)棄去還原液,加入由0.001% UGF202,5%氮氮二甲基甲酰胺(DMF)和40%乙醇(EtOH)組成的染色液,作用20分鐘;
9、 (5)置于凝膠成像儀上成像。
5.基于SDS-PAGE凝膠上糖蛋白的熒光檢測(cè),分別從靈敏度、選擇性、檢測(cè)時(shí)間以及檢測(cè)成本的角度等去比較新建立UGF202的檢測(cè)技術(shù)與Pro-QEmerald糖蛋白檢測(cè)試劑盒:結(jié)果發(fā)現(xiàn)UGF202的檢測(cè)靈敏度是Pro-QEmerald試劑盒的2-4倍,在檢測(cè)特異性方面也略優(yōu)于Pro-Q Emerald試劑盒,并且大幅度地縮短了檢測(cè)時(shí)間,提高了檢測(cè)效率。
6.聯(lián)合二向凝膠電泳分離技術(shù)和
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