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文檔簡(jiǎn)介
1、目的:通過(guò)研究Graves病患者與健康對(duì)照者糞便樣品中的微生物種類(lèi)及數(shù)量,探索Graves病患者腸道菌群結(jié)構(gòu)是否存差異及差異菌群與該病發(fā)生發(fā)展的關(guān)系。
方法:收集Graves病患者(14例)及健康對(duì)照者(13例)的新鮮糞便作為研究標(biāo)本,根據(jù)年齡、性別匹配入組,用試劑盒提取糞便樣品中的細(xì)菌基因組DNA。根據(jù)細(xì)菌的16SrRNA基因序列設(shè)計(jì)V3區(qū)通用引物,用聚合酶鏈反應(yīng)-變性梯度凝膠電泳法(PCR-DGGE)觀察兩組腸道菌群的
2、差異,找出差異條帶、切膠回收、純化、克隆后進(jìn)行基因測(cè)序,將測(cè)序結(jié)果經(jīng)NCBIGenBank對(duì)比后確定菌群種類(lèi)。
結(jié)果:變性梯度凝膠電泳后,Graves患者與健康對(duì)照組可見(jiàn)差異性條帶,各組經(jīng)QuantityOne4.6.2軟件分析發(fā)現(xiàn):第一組實(shí)驗(yàn)樣品中,Graves病組與健康對(duì)照組的腸道菌群多樣性差異無(wú)意義(P>0.05),Dice相似系數(shù):組間相似度小于兩組組內(nèi)相似度,后經(jīng)聚類(lèi)分析可見(jiàn),除G8、G10樣品外,Graves病
3、組與健康對(duì)照組樣品均分別聚為一類(lèi);第二組實(shí)驗(yàn)樣品中,Graves病組與健康對(duì)照組的腸道菌群多樣性差異無(wú)意義(P>0.05),Dice相似系數(shù):組間相似度小于兩組組內(nèi)相似度,除G6樣品外,其他樣品均分別聚為一類(lèi);第三組實(shí)驗(yàn)樣品中,Graves病組與健康對(duì)照組的腸道菌群多樣性差異有意義(P<0.05),Dice相似系數(shù):組間相似度小于兩組組內(nèi)相似度,后經(jīng)聚類(lèi)分析可見(jiàn),除C11樣品外,其他樣品均分別聚為一類(lèi)。
從腸道菌群多樣性分
4、析來(lái)看,Graves病組與健康對(duì)照組的腸道菌群多樣性無(wú)顯著差異。聚類(lèi)分析結(jié)果顯示,Graves病組聚為一類(lèi),健康對(duì)照組聚為一類(lèi),說(shuō)明健康對(duì)照組和Graves病組的腸道菌群豐度有所不同,確實(shí)存在差異。進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)Graves病人腸道優(yōu)勢(shì)菌群與正常健康組的有所不同,第一組G2~G5樣品第24號(hào)條帶在Graves病腸道菌群中優(yōu)勢(shì)明顯,但在健康對(duì)照組中并未顯示出優(yōu)勢(shì)性,將其切割回收測(cè)序,經(jīng)GenBank比對(duì)后,鑒定為普雷沃菌屬。
結(jié)
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