基因序列拼接算法的研究.pdf_第1頁
已閱讀1頁，還剩66頁未讀， 繼續(xù)免費閱讀

下載本文檔

版權說明：本文檔由用戶提供并上傳，收益歸屬內容提供方，若內容存在侵權，請進行舉報或認領

文檔簡介

1、生物信息學是一門綜合利用生物學、計算機科學、數學等學科知識的新興交叉學科，其主要任務是揭示海量生物學數據中蘊含的生物學意義、探索生命活動的奧秘。全基因組DNA序列拼接是生物信息學研究的重要課題。在大規(guī)模DNA測序中普遍使用的Shotgun方法中，片段序列的拼接是一個關鍵而又費時的過程，其中包含了一些實際困難，重復子序列對片段間正確重疊的干擾就是其中一個。如何提高序列拼接的精度和速度是本課題研究的重點。 本文在深入分析現有拼接

2、算法及其實現軟件的基礎上，針對分布式并行計算環(huán)境，提出了優(yōu)化的DNA序列拼接并行算法P Assembler，分別對序列拼接中的Overlap、Layout和Consensus階段的串行處理過程和并行算法進行了探討，通過分析數據集的劃分方法和串行處理過程的可并行性，提出了多種不同的并行處理策略并加以比較與分析，理論和實驗結果都驗證了并行處理后序列拼接算法效率大大提高。除此之外，論文針對DNA序列拼接中比較棘手的重復序列問題，提出了一種改進

溫馨提示

  • 1. 本站所有資源如無特殊說明，都需要本地電腦安裝OFFICE2007和PDF閱讀器。圖紙軟件為CAD,CAXA,PROE,UG,SolidWorks等.壓縮文件請下載最新的WinRAR軟件解壓。
  • 2. 本站的文檔不包含任何第三方提供的附件圖紙等，如果需要附件，請聯(lián)系上傳者。文件的所有權益歸上傳用戶所有。
  • 3. 本站RAR壓縮包中若帶圖紙，網頁內容里面會有圖紙預覽，若沒有圖紙預覽就沒有圖紙。
  • 4. 未經權益所有人同意不得將文件中的內容挪作商業(yè)或盈利用途。
  • 5. 眾賞文庫僅提供信息存儲空間，僅對用戶上傳內容的表現方式做保護處理，對用戶上傳分享的文檔內容本身不做任何修改或編輯，并不能對任何下載內容負責。
  • 6. 下載文件中如有侵權或不適當內容，請與我們聯(lián)系，我們立即糾正。
  • 7. 本站不保證下載資源的準確性、安全性和完整性, 同時也不承擔用戶因使用這些下載資源對自己和他人造成任何形式的傷害或損失。

評論

0/150

提交評論