豬霍亂沙門(mén)氏菌SC-B67全基因組測(cè)序和比較基因組學(xué)研究.pdf

1、本文詳細(xì)報(bào)道了人畜共生菌豬霍亂沙門(mén)氏菌株SC-B67(Salmonella entericaserovar Choleraesuis strain SC-B67)的全基因組測(cè)序以及與Salmonella Typhi,Salmonella Typhimurium，Salmonella Paratyphi A的比較基因組學(xué)分析。介紹了他們?cè)谌旧w和質(zhì)粒的保守性，致病性，抗藥性，移動(dòng)序列，代謝調(diào)控以及在進(jìn)化方面的異同點(diǎn)。
　　 S.C

2、holeraesuis SC-B67基因組由一條染色體和兩個(gè)質(zhì)粒組成.其中染色體的長(zhǎng)度為4，755，700 bp，編碼4447個(gè)ORF。假基因的個(gè)數(shù)為151個(gè)，其中大多數(shù)在S. Typhimurium及S.Typhi中是保持完整的。有一些假基因是與細(xì)菌的運(yùn)動(dòng)性和化學(xué)信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)代謝途徑相關(guān)的。我們推測(cè)因?yàn)檫@些假基因的引入，使細(xì)菌能夠更加平滑的運(yùn)動(dòng)，從而使細(xì)菌與上皮細(xì)胞的互相作用更加的有效，進(jìn)而能夠?qū)е录?xì)菌發(fā)生高頻率的入侵作用。2個(gè)質(zhì)粒中，大

3、質(zhì)粒pSC138的長(zhǎng)度為138，742 bp，編碼176個(gè)ORF，pSC138有8個(gè)插入序列以及7個(gè)轉(zhuǎn)座子.這些可移動(dòng)元件使pSC138具有很高的可塑性，能夠與其他細(xì)菌和質(zhì)粒進(jìn)行遺傳物質(zhì)的交流.與這些可移動(dòng)因子伴隨著的是抗藥基因，包括dhfr((甲氧氨嘧啶)，sulI和sulII(磺胺類藥物)，catl和cmlA(氯霉素)，bla(TEM-1；氨比西林)，strA和aad2(鏈霉素)，tetR(四環(huán)素)，aph(卡那霉素)，sat(鏈絲

4、菌素)，mef(大環(huán)內(nèi)酯物)，mer(水銀)，ebr(溴乙非啶)和qac(季胺類化合物).pSC138幾乎對(duì)現(xiàn)在在臨床上應(yīng)用的所有主流抗生素都具有抗藥性.這些基因都是pSC138通過(guò)插入序列而獲得的。pSC138所攜帶的抗藥性能夠顯著的提高沙門(mén)氏菌在不同宿主環(huán)境中的存活率.另外一個(gè)質(zhì)粒是pSCV50，長(zhǎng)度為49，588bp，編碼52個(gè)ORF.我們將它與已測(cè)序的pKDSC50致病質(zhì)粒進(jìn)行了比較，發(fā)現(xiàn)總共具有42處92個(gè)核苷酸的不同.突變多

5、發(fā)區(qū)主要集中在功能位置區(qū)域和非毒性相關(guān)的轉(zhuǎn)移區(qū)。而其他位置的變化速率比較平穩(wěn)，反應(yīng)了因?yàn)楣δ苤匾缘牟煌?，所以受到進(jìn)化選擇的壓力也不一樣，與毒性相關(guān)區(qū)域的進(jìn)化溫和且緩慢，表明它們對(duì)細(xì)菌完成侵染和自身生存具有重要的意義。
　　 我們還對(duì)另外一株豬霍亂沙門(mén)氏菌OU7519的具毒性及抗藥性質(zhì)粒pOU7519進(jìn)行了測(cè)序。該質(zhì)粒全長(zhǎng)為127，212 bp，編碼146個(gè)ORF.進(jìn)行序列比對(duì)后發(fā)現(xiàn)pOU7519由2，015-49，558的位置