多重耐藥鮑曼不動桿菌基因組與“耐藥島”的比較基因組學(xué)研究.pdf

1、鮑曼不動桿菌是臨床感染常見病原菌，其耐藥菌株已出現(xiàn)全球流行的趨勢。本研究應(yīng)用第二代高通量測序技術(shù)完成了一株國內(nèi)流行的多重耐藥鮑曼不動桿菌MDR-ZJ06的全基因組序列分析工作。MDR-ZJ06同源于國際流行的歐洲克?、蚓?，其基因組染色體全長近4Mbp，還攜帶一個20kb大小的質(zhì)粒。染色體共編碼3887個蛋白，質(zhì)粒編碼25個蛋白。菌株MDR-ZJ06上發(fā)現(xiàn)一個AbaR類型耐藥島，命名為AbaR22，大小為38.6kb，其基本結(jié)構(gòu)特征同歐

2、洲克?、窬闍YE和AB0057攜帶耐藥島比較相似，但其中耐藥基因數(shù)量明顯偏少。在菌株MDR-ZJ06染色體上還發(fā)現(xiàn)攜帶blaOXA-23基因的復(fù)合轉(zhuǎn)座子Tn2009，blaOXA-23基因上下游均存在插入序列ISAba1，既可以轉(zhuǎn)移blaOXA-23基因，也提高了其表達水平，從而介導(dǎo)菌株對碳青霉烯類抗生素耐藥。細菌攜帶質(zhì)粒pZJ06中編碼16S rRNA甲基化酶ArmA，可以介導(dǎo)氨基糖苷類抗生素高水平耐藥，armA的遺傳環(huán)境同該基因在

3、腸桿菌科細菌中的環(huán)境非常類似，提示了鮑曼不動桿菌有很強的接受外源DNA片段的能力，其基因組具備高度可塑性。
　　通過對9株已完成基因組測序的鮑曼不動桿菌的比較基因組學(xué)分析，我們發(fā)現(xiàn)了基因組上的一個潛在的“耐藥島”，命名為AbaGI?！澳退帊u”AbaGI區(qū)域的GC含量與插入位點兩側(cè)比較時有一個明顯的變化波折，同時在AbaGI區(qū)域上游編碼一個tRNA-Val基因，這些均表明該區(qū)域為整合插入的外源DNA片段。我們挑選了39株臨床分離鮑曼