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文檔簡介
1、目的:
本研究主要探討microRNA-548z(miR-548z)是否能與CD147基因3'非翻譯區(qū)(untranslated region,UTR)單核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)(single nucleotide polymorphism,SNP) rs8259 T/A結(jié)合,以及結(jié)合后對急性心肌梗死(acute myocardial infarction,AMI)患者CD147表達(dá)的影響。
方法:
通過生物信息學(xué)
2、方法預(yù)測CD147基因3'UTR上可能結(jié)合的miRNAs,并與NCBI數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對,選出與rs8259 T/A結(jié)合的miRNA(即miR-548z),運(yùn)用雙熒光素酶報告基因驗(yàn)證miR-548z與rs8259 T/A的相互作用。以30例AMI患者及13例正常人作為研究對象,應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(polymerasechain reaction-restriction fragment length polymorphi
3、sm,PCR-RFLP)技術(shù)檢測CD147基因rs8259位點(diǎn)的基因型,并通過直接測序法驗(yàn)證所獲得基因型的真實(shí)性。外周血單個核細(xì)胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)中miR-548z及CD147 mRNA的表達(dá)采用熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(quantitative polymerase chainreaction qPCR)法檢測,應(yīng)用Westem Blot法檢測PBMCs中CD147蛋白的
4、表達(dá)。
結(jié)果:
(1)運(yùn)用TargetScan在線軟件預(yù)測顯示,CD147基因3'UTR存在多個miRNA結(jié)合位點(diǎn)。再與NCBI數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對,我們發(fā)現(xiàn)CD147基因3'UTR的SNP位點(diǎn)rs8259恰好位于miR-548z結(jié)合的種子區(qū)。
(2)雙熒光素酶報告基因結(jié)果顯示,mimic miR-548z能夠抑制攜帶CD147基因rs8259位點(diǎn)T等位基因載體的熒光素酶活性,并且該效應(yīng)呈劑量依賴性。而對攜帶A等
5、位基因的載體無類似作用。
(3)以U6作為內(nèi)參,比較AMI患者與正常人PBMCs中miR-548z的相對表達(dá)水平,兩組間并無統(tǒng)計學(xué)差異(p值為0.825)。
(4)同樣以U6作為內(nèi)參,比較AA型和TT型AMI患者PBMCs中miR-548z的相對表達(dá)水平,兩組間無統(tǒng)計學(xué)差異(p值為0.518)。
(5)AMI患者AA型和TT型PBMCs中CD147 mRNA的表達(dá)水平無差異(p=0.645);
(
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