PPIL6基因的生物信息學(xué)分析及其在兒童急性淋巴細(xì)胞白血病的表達(dá).pdf

1、研究背景:急性淋巴細(xì)胞白血病(acute lymphoblasticleukemia,ALL)是我國(guó)兒童和青少年最常見(jiàn)的惡性腫瘤性疾病,占兒童白血病70％左右。近年來(lái)隨著白血病治療方法的進(jìn)展,ALL患兒的完全緩解率及長(zhǎng)期無(wú)病生存率有顯著的提高,但仍有少數(shù)患兒療效差,其中對(duì)化療不敏感和復(fù)發(fā)是治療失敗的主要因?yàn)?而其主要分子機(jī)制至今仍不清楚。近年來(lái)研究認(rèn)為,痛基因的轉(zhuǎn)化和抑癌基因的畸變?cè)贏LL的發(fā)生發(fā)展中有重要作用,因此對(duì)它們進(jìn)行深入研究有

2、助于尋找新的改善ALL預(yù)后的治療方法。郭碧贊、康睿等研究發(fā)現(xiàn)位于6q21區(qū)域內(nèi)的PPIL6基因可能是一個(gè)新的候選腫瘤抑制基因。進(jìn)一步研究PPIL6基因表達(dá)與ALL發(fā)生發(fā)展的關(guān)系,有助于篩選可用于ALL早期診斷、病情變化監(jiān)測(cè)及預(yù)后判斷的抑癌基因,從而為ALL的基因靶向治療提供新的思路。
　　 目的:以人類基因組數(shù)據(jù)庫(kù)為基礎(chǔ),對(duì)PPIL6基因進(jìn)行生物信息學(xué)分析,為進(jìn)一步研究PPIL6基因的功能、進(jìn)一步選擇動(dòng)物模型克隆PPIL6基因及

3、進(jìn)行功能研究提供理論基礎(chǔ)。并通過(guò)檢測(cè)PPIL6基因在初治、復(fù)發(fā)與緩解組ALL患兒及對(duì)照組的表達(dá),探討PPIL6基因表達(dá)在兒童急性淋巴細(xì)胞白血病(ALL)發(fā)生發(fā)展中的意義。
　　 方法:根據(jù)GeneBank中已登錄的PPIL6基因序列,利用生物信息學(xué)軟件對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析。應(yīng)用RT-PCR法分別檢測(cè)46例急性淋巴細(xì)胞白血病患兒(其中包括初治組20例,緩解組16例,復(fù)發(fā)組10例)及14例貧血查因患兒骨髓單個(gè)核細(xì)胞(bone ma

4、rrowmononuclear cells,BMMCs)中PPIL6基因的表達(dá)水平,分析PPIL6表達(dá)水平與ALL發(fā)生發(fā)展及預(yù)后的關(guān)系。
　　 結(jié)果:PPIL6的cDNA全長(zhǎng)為4223 bp,分布于一個(gè)位于NC001111298基因組序列中,定位于6q21。PPIL6基因家族序列在人及其他8種常見(jiàn)物種中高度保守。人類PPIL6基因編碼的蛋白產(chǎn)物由337個(gè)氨基酸組成,分子式是C1722H2658N474O495S12,是一略顯堿性

5、的蛋白質(zhì)。PPIL6基因編碼產(chǎn)物廣泛分布于細(xì)胞膜、細(xì)胞核及多種細(xì)胞器中。ALL初治組及復(fù)發(fā)組患兒的PPIL6基因表達(dá)水平(0.25±0.19,0.32±0.15)明顯低于對(duì)照組(0.55±0.33),差異有顯著性(P<0.05)；緩解組患兒PPIL6基因表達(dá)水平明顯高于初治組患兒(0.51±0.33 VS0.25±0.19),差異有顯著性(P<0.05)；緩解組患兒PPIL6基因的表達(dá)水平高于復(fù)發(fā)組(0.51±0.33 vs0.32±0