利用AFLP和SSR標(biāo)記研究六個(gè)肉兔群體的遺傳多樣性.pdf

1、為進(jìn)一步提高肉兔的產(chǎn)量和質(zhì)量，保證肉兔養(yǎng)殖業(yè)的可持續(xù)發(fā)展，進(jìn)行肉兔的遺傳育種改良、增加肉兔的遺傳多樣性已成為人們關(guān)注的課題。DNA分子標(biāo)記所具有的穩(wěn)定性、準(zhǔn)確性和可靠性使其能夠準(zhǔn)確的反映生物的遺傳信息。本試驗(yàn)利用AFLP和SSR兩種分子標(biāo)記研究了6個(gè)肉兔群體的遺傳變異和遺傳結(jié)構(gòu)，以期為肉兔的遺傳育種工作提供一定的理論依據(jù)。 本研究對(duì)象為6個(gè)肉兔群體，其中GD14、GD24、、GD54、GD64來自于法國(guó)克里莫公司的商業(yè)配套系，新

2、西蘭兔來源于美國(guó)，蓮山黑兔來自中國(guó)本土。本試驗(yàn)篩選了7對(duì)SSR引物和8對(duì)AFLP選擇性擴(kuò)增引物組合。利用Popgen32軟件分析了群體內(nèi)的遺傳變異和群體間的遺傳結(jié)構(gòu)，計(jì)算群體間的遺傳距離，并利用MEGA3.1軟件，UPGMA法構(gòu)建6個(gè)群體的系統(tǒng)發(fā)生樹。兩種方法所得的結(jié)果如下： (1)利用八對(duì)AFLP引物組合共擴(kuò)增出586個(gè)位點(diǎn)，其中有257個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)，平均每個(gè)引物擴(kuò)增出32.125個(gè)多態(tài)性的位點(diǎn)。七對(duì)SSR引物共擴(kuò)增出39個(gè)等

3、位基因，平均每個(gè)位點(diǎn)為5.5714個(gè)。在檢測(cè)遺傳變異時(shí)兩種方法都表明6個(gè)群體均具有較高多態(tài)性，而且SSR檢測(cè)到的變異性明顯高于AFLP標(biāo)記的檢測(cè)結(jié)果，兩種方法檢測(cè)的有效等位基因數(shù)(NE)分別為1.2885(AFLP)和3.0759(SSR)，AFLP檢測(cè)到的雜合度Nei(H)指數(shù)分布在0.1200和0.1556之間：SSR檢測(cè)的觀測(cè)雜合度分布在0.7679和0.8691之間。 (2)SSR有效等位基因數(shù)，香農(nóng)指數(shù)等遺傳變異參數(shù)明

4、顯高于AFLP技術(shù)，而AFLP能夠獲得比SSR技術(shù)更高效的多態(tài)位點(diǎn)數(shù)檢出率。盡管兩種方法所得的結(jié)果有些差別，但它們所得的6個(gè)群體的遺傳多樣性順序是一致的，，即蓮山黑兔群體的遺傳多樣性最高，接下來依次是GD14、GD24、新西蘭兔、GD64、GD54。檢測(cè)結(jié)果與群體的遺傳背景相符：蓮山黑兔為正在提純選育中的地方品種，雜合度最高；GD14、GD24為兩個(gè)專門化母系，雜合度較高；新西蘭兔為純種兔，雜合度較低；而GD64、GD54為兩個(gè)專門化父

5、系，雜合度最低。 (3)利用兩種方法計(jì)算的6個(gè)群體的遺傳距離分布在0.0155到0.0664(AFLP)之間和0.0350到0.5473(SSR)之間。兩種分子標(biāo)記方法的聚類結(jié)果之間雖存在部分差異，基于兩種方法的遺傳距離所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)生樹表明6個(gè)群體的聚類結(jié)果趨勢(shì)一致：GD14和GD24群體聚為一類；GD54和GD64聚為一類，接著這兩類聚在一起后和新西蘭兔聚在一起，然后蓮山黑兔經(jīng)過很長(zhǎng)的距離與其他的群體聚在一起。該結(jié)果進(jìn)一步印

6、證了6個(gè)肉兔群體的遺傳背景，為肉兔配套系中合理選擇使用育種材料、預(yù)測(cè)系間配合力提供了遺傳依據(jù)。 (4)應(yīng)用AFLP技術(shù)獲得一條蓮山黑兔特有的指紋條帶。 (5)根據(jù)試驗(yàn)結(jié)果對(duì)雜交優(yōu)勢(shì)進(jìn)行了預(yù)測(cè)，為肉兔的分子標(biāo)記輔助育種的親本選擇方面提供理論依據(jù)。 (6)依據(jù)SSR和AFLP標(biāo)記的原理，兩種方法揭示的肉兔基因組水平的遺傳多樣性信息不同，用兩種方法進(jìn)行肉兔遺傳多樣性分析能為肉兔育種提供更加有用的信息。 通過對(duì)6