水稻粒形相關(guān)基因變異位點的功能標(biāo)記開發(fā)及其應(yīng)用.pdf

1、水稻（Oryza sativa L.）是我國重要的糧食作物，通過創(chuàng)新育種方法來選育優(yōu)良水稻品種是提高水稻產(chǎn)量和品質(zhì)的重要途徑之一。近年來，隨著分子生物學(xué)和基因組學(xué)的不斷發(fā)展，分子育種作為傳統(tǒng)育種方法的補充也在不斷的創(chuàng)新和完善。
　　水稻粒形與水稻產(chǎn)量和品質(zhì)密切相關(guān)，研究控制水稻粒形的相關(guān)基因?qū)λ具z傳改良具有重要的理論意義和生產(chǎn)實用價值。水稻粒形涉及到多個基因（酶），因此水稻粒形是一個非常復(fù)雜的性狀。
　　本研究選用對水稻粒

2、形有重要貢獻的GW8、GS5、GW5、GS3和qGL3基因為研究對象，基于網(wǎng)上公共數(shù)據(jù)庫目標(biāo)基因的序列比對，分析這五個基因的序列變異信息，發(fā)展了9個相關(guān)序列變異位點的特異分子標(biāo)記，并對水稻微核心種質(zhì)材料進行了鑒定;結(jié)合水稻微核心種質(zhì)籽粒性狀指標(biāo)（粒長、粒寬、粒厚、長寬比和千粒重）的數(shù)據(jù)，研究上述五個粒形相關(guān)基因各變異位點和單元型（Haplotype）對水稻籽粒性狀的效應(yīng)，研究結(jié)果對水稻分子設(shè)計育種有著重要的指導(dǎo)價值。
　　本研究主

3、要的結(jié)果如下:
　　1、本文涉及的水稻微核心種質(zhì)資源是一個包含294份水稻品種的自然群體，含有豐富的遺傳變異，在水稻粒長、粒寬、粒厚、長寬比和千粒重等農(nóng)藝性狀上均表現(xiàn)為近似正態(tài)分布。
　　2、本文涉及五個基因（GW8、GW5、GS3、GS5和qGL3）的9個變異位點為基因啟動子區(qū)的變異或編碼區(qū)的錯義突變，我們對這些變異位點分別設(shè)計和發(fā)展了相應(yīng)的PCR標(biāo)記，并用這些標(biāo)記對水稻微核心種質(zhì)進行了基因型檢測。
　　3、t測驗表

4、明這9個變異位點對水稻籽粒性狀有著不同程度的影響，因此這些變異位點稱為功能變異位點。另外GS3基因Exon-5(5955bp)處13bp缺失和qGL3基因Exon-1(4332bp)處堿基A變異類型在水稻微核心種質(zhì)中各對應(yīng)1個水稻品種，分布頻率極低，所以這2個位點為稀有變異位點。
　　4、基因GW8、GW5每個變異位點對水稻粒長、粒寬、粒厚和長寬比均有極顯著的影響;基因GS5兩個變異位點對水稻粒長、粒寬、粒厚和長寬比均有顯著的影響

5、;基因GW8、GW5、GS5每個變異位點對千粒重均沒有顯著的影響?；騁S3第2外顯子(2251bp)處A/C變異對粒長、粒寬、粒厚和長寬比均有極顯著的影響，對千粒重沒有顯著的影響;基因GS3第5外顯子(5955bp)處13bp插入缺失對粒寬、長寬比和千粒重均有極顯著的影響，對粒長和粒厚均有顯著的影響?；騫GL3第1外顯子(4332bp)處堿基A/C變異對水稻粒寬、粒厚、長寬比和千粒重均有極顯著的影響，對粒長沒有顯著的影響。
　

6、　5、基因GW8、GS3和GS5的不同單元型對水稻籽粒性狀有著不同程度的影響:基因GW8不同單元型對水稻微核心種質(zhì)的粒長、粒寬、粒厚和長寬比均有極顯著的影響，對千粒重沒有顯著的影響;基因GS5的不同單元型只對水稻微核心種質(zhì)的粒長有顯著的影響;基因GS3兩種單元型對水稻微核心種質(zhì)的粒長、粒寬、粒厚和長寬比均有極顯著的影響，對千粒重沒有顯著的影響?；騁W8和GS3在水稻微核心種質(zhì)中各存在一個稀有單元型。
　　6、本研究同時利用9個功