6個黃牛品種ND5、GHSR基因遺傳變異及其與生長性狀關(guān)聯(lián)分析.pdf

1、本研究采用PCR-SSCP分子標記和DNA測序技術(shù)對ND5、GHSR兩個基因在南陽牛、秦川牛、郟縣紅牛、晉南牛、安格斯牛和中國荷斯坦牛6個群體共714個個體的遺傳變異進行分析，并探討了南陽牛、秦川牛、郟縣紅?；蜻z傳變異與生長性狀之間的相關(guān)性，為這三個黃牛品種進一步選育從理論上提供幫助。本研究取得以下結(jié)論： 1.6個黃牛品種ⅣD5基因遺傳特性分析 應(yīng)用PCR-SSCP技術(shù)對6個黃牛品種mtDNAND5基因3個基因座進行多

2、態(tài)性分析。結(jié)果表明：N1與N3基因座的PCR產(chǎn)物經(jīng)SSCP檢測僅存在一種帶型。N2基因座存在A、B兩種單倍型，發(fā)現(xiàn)3個SNP，12900 T>C、12923.A>T、12924 C>T(與NC.006853對照)，其中，12900 T>C位屬于同義突變，12923 A>T、12924 C>T兩位突變處于同一密碼子的二、三位，致使苯丙氨酸變?yōu)槔野彼?。?個黃牛群體中，N2基因座A單倍型頻率分別為0.167、0.134、0.139、0.11

3、7、0.041、0.066。 2.ND5基因多態(tài)性與牛生長性狀之間的關(guān)聯(lián)分析 ND5基因遺傳變異與南陽牛的管圍、坐骨端寬、體重、體斜長、體高、日增重等性狀之間進行關(guān)聯(lián)分析，發(fā)現(xiàn)在6月齡坐骨端寬指標上，B單倍型高于A單倍型，差異極顯著(P<0.01)；在6月齡體重、體斜長、體高、日增重等指標上，B單倍型也高于A單倍型，差異顯著(P<0.05)。在24月齡體高指標上，A單倍型高于B單倍型，差異極顯著(P<0.01)；但在12

4、、18月齡南陽牛群體中沒有相關(guān)。 ND5基因的遺傳變異與秦川牛、郟縣紅牛生長性狀間進行關(guān)聯(lián)分析，發(fā)現(xiàn)秦川牛與ND5基因變異沒有相關(guān)。在郟縣紅牛群體中，坐骨端寬指標是A單倍型高于B單倍型，差異極顯著(P<0.01)。 3.6個黃牛品種GHSR基因遺傳特性分析 對GHSR基因全部外顯子區(qū)共4個基因座G1、G2、G3和G4進行遺傳變異分析。 首次檢測到四個突變SNP，nt-7、nt456、nt667和nt355

5、2(參考XM.592014的序列，轉(zhuǎn)錄起始位點為+1)。 G1基因座存在三種帶型，在-7位發(fā)生了堿基C>A突變。G1基因座等位基因C基因頻率在南陽牛、秦川牛、郟縣紅牛、晉南牛、安格斯牛和中國荷斯坦6個黃牛品種中分別為0.729、0.557、0.543、0.536、0.539、0.852。G2基因座發(fā)現(xiàn)兩個SNP，分別在456、667位發(fā)生了堿基G>A、C>T的突變。該兩處突變完全連鎖，三種基因型分別命名為AA、AB、BB型，在所有研究群

6、體中，沒有檢測到BB基因型。G2基因座等位基因A基因頻率6個黃牛品種中分別為0.889、0.855、0.891、0.903、0.762、0.910。G4基因座僅發(fā)現(xiàn)一個SNP，在3552位發(fā)生了堿基C>T突變，存在兩種帶型，G4基因座等位基因C基因頻率在6個黃牛品種中分別為0.556、0.549、0.577、0.540、0.560、0.508。6個群體G1基因座均處于Hardy．Weinberg平衡狀態(tài)。南陽牛、秦川牛、郟縣紅牛、晉南牛

7、和安格斯牛G1基因座遺傳多態(tài)性處于中度多態(tài)，荷斯坦牛G1基因座處于低度多態(tài)。6個群體G2基因座均處于Hardy．Weinberg平衡狀態(tài)。郟縣紅牛和安格斯牛G2基因座遺傳多態(tài)性處于中度多態(tài)，南陽牛、秦川牛、晉南牛和荷斯坦牛G2基因座遺傳多態(tài)性處于低度多態(tài)。其中，荷斯坦牛多態(tài)信息含量最低。6個群體G4基因座均處于Hardy-Weinberg不平衡狀態(tài)。南陽牛、秦川牛、郟縣紅牛、晉南牛、安格斯牛和荷斯坦牛6個黃牛品種中G4基因座遺傳多態(tài)性均

8、處于中度多態(tài)。 4.基因多態(tài)性與生長性狀之間的關(guān)聯(lián)分析 GHSR基因G1、G2和G4基因座的遺傳變異與南陽牛、秦川牛、郟縣紅牛生長性狀之間進行關(guān)聯(lián)分析。G1基因座不同基因型在郟縣紅牛群體中，BB基因型腰角寬、尻長顯著大于AA基因型(P<0.05)；在秦川牛群體中AB基因型腰角寬顯著大于BB基因型(P<0.05)。G2基因座南陽牛6月齡體重和日增重AA基因型顯著高于AB基因型(P<0.05)，但在12/18/24月齡時差異