山羊Agouti基因與毛色表型相關分析及其遺傳變異的研究.pdf

1、本試驗根據(jù)GenBank上已發(fā)表的牛(X99691)、豬(AJ427478)馬(AF288358)和人的Agouti因序列設計引物，擴增山羊Agouti基因外顯子1和內含子1的部分序列片斷，內含子1的部分序列與本實驗室之前測得的山羊Agouti基因序列片斷(GenBank序列號:EF587236)進行拼接，得到5270bp長度的山羊Agouti基因序列。比對分析我們得到的序列，又發(fā)現(xiàn)了2個SNPs，再對編碼區(qū)外顯子4的唯一SNP位點進行

2、分析，根據(jù)拼接結果命名這些突變位點，分別為399C>T、128delT和5701G>T。其中，5701.G>T的突變引起了山羊Agouti信號蛋白125位上氨基酸的改變(甘氨酸→纈氨酸)。本試驗僅選取128delT和5701G>T兩個位點進行研究。 本研究利用PCR-RFLP技術對9個中國地方山羊品種，總共545個樣品的山羊Agouti基因5701G>T位點進行研究。在5701G>T位點上檢測到2個等位基因，存在3種基因型:TT

3、、TG和GG。其中，T等位基因在被檢測的大多數(shù)山羊品種中是優(yōu)勢等位基因，再結合相應山羊品種的毛色表型進行相關性分析，我們推測，5701G>T位點的T等位基因與山羊的黑色表型有關或者是該位點與控制山羊黑色表型的位點存在連鎖關系。遺傳多樣性分析指標表明，5701G>T位點在中國黑色山羊品種中的遺傳多樣性較低。群體遺傳分化分析結果表明，9個地方山羊群體間的遺傳分化系數(shù)僅為0.2615。聚類分析也基本符合毛色表型的分類，并且在不同的群體中，隨著

4、T等位基因頻率的升高，其成年體重降低，這可能是由于Agouti基因外顯子4中的5701G>T位點與山羊的生長速度有關。 本研究同樣利用PCR-RFLP技術檢測了128delT缺失突變位點在國內十個山羊品種中的多態(tài)性并與毛色進行了相關性分析。結果表明，128delT缺失位點存在兩個等位基因A(缺失)和B(不缺失)，共產(chǎn)生三種基因型AA、AB和BB，其中AB基因型在白色山羊品種中占優(yōu)勢(76.14％)，從基因型在棕褐色山羊品種中頻率