金黃色葡萄球菌Sa240結(jié)構(gòu)和功能及人組蛋白去甲基化酶mina53結(jié)構(gòu)研究.pdf

1、(1)核糖吡喃酶催化核糖由吡喃糖形式轉(zhuǎn)換為呋喃糖形式。序列比對顯示核糖吡喃酶在細(xì)菌中是保守的?？莶菅挎邨U菌的核糖吡喃酶RbsD(BsRbsD)的晶體結(jié)構(gòu)顯示,在一個不對稱單位中有五個BsRbsD分子,形成一個五元環(huán),兩個晶體學(xué)對稱相鄰的BsRbsD五聚體形成一個十聚體。BsRbsD的核糖結(jié)合位點位于兩個相鄰亞基間的相互作用界面。
　　 金黃色葡萄球菌是革蘭氏陽性菌,是重要的人和動物的致病菌。金黃色葡萄球菌的Sa240是枯草芽孢桿

2、菌核糖吡喃酶BsRbsD的同源蛋白。我們測定了Sa240蛋白的晶體結(jié)構(gòu)以及Sa240蛋白與核糖復(fù)合物的晶體結(jié)構(gòu)。Sa240的結(jié)構(gòu)是一個αβα三明治結(jié)構(gòu)。在一個不對稱單位有四個Sa240分子,兩兩之間形成二聚體,兩個二聚體以非晶體學(xué)二重旋轉(zhuǎn)對稱形成四聚體。每個Sa240分子都有兩個與相鄰的亞基相互作用界面。亞基AB間或亞基CD間相互作用面積約1080(A)2,相互作用較強(qiáng),能形成穩(wěn)定的二聚體,在溶液中穩(wěn)定存在。亞基AC間或亞基BD間相互作

3、用面積約300(A)2,相互作用較弱,這種二聚體形式可能是晶體堆積的結(jié)果,在溶液中不能穩(wěn)定存在。這與Sa240在溶液中是以二聚體形式存在的結(jié)果一致。與BsRbsD的結(jié)構(gòu)比較顯示,在Sa240的結(jié)構(gòu)中,羧基末端和連接β1-β2的loop都偏向五元環(huán)中相鄰亞基的結(jié)合部位,這可能形成空間位阻,阻礙Sa240以類似于枯草芽孢桿菌的核糖吡喃酶RbsD(BsRbsD)的方式形成五聚體。在Sa240和核糖的復(fù)合物晶體結(jié)構(gòu)中,核糖以吡喃糖形式存在,核糖

4、結(jié)合位點由一個亞基提供,沒有相鄰亞基提供的對核糖吡喃酶活性重要的組氨酸,表明以二聚體形式存在的Sa240沒有吡喃酶活性的?；诮Y(jié)構(gòu)分析和酶反應(yīng)機(jī)制分析,我們認(rèn)為核糖吡喃酶活性依賴于蛋白質(zhì)的聚集狀態(tài),以二體存在的Sa240沒有核糖吡哺酶活性。
　　 (2)Mina53(Myc-inducednuclearantigenwithamolecularmassof53kDa)是MYC的直接靶蛋白,調(diào)控哺乳動物細(xì)胞的增殖。Mina53在食