檉柳SSR標記開發(fā)及群體遺傳結(jié)構(gòu)分析.pdf

1、本文采用微衛(wèi)星(EST-SSE)分子標記技術(shù)，研究了6個檉柳 (Tamarixchinensis)群體的遺傳多樣性，揭示其群體遺傳結(jié)構(gòu)，并在遺傳多樣性研究的基礎(chǔ)上，探討檉柳種質(zhì)資源的保存方法。主要結(jié)果如下： 從來源于檉柳科的 22713 條 EST 序列中，檢索出包含SSR 的 EST序列546條。其中含二核苷酸重復單元和三核苷酸重復單元的SSR-ESTs分別為(30.9％)和(31.6％)。共合成75條設(shè)計引物用于檉柳的擴增，

2、結(jié)果40對引物得到清晰的擴增條帶，其中17對引物表現(xiàn)明顯的多態(tài)性。為檉柳的遺傳學研究提供一些高效的分子標記。 17對SSR引物在6個群體中共擴增出的等位基因 (A)平均有7.1765個，有效等位基因數(shù)(Ne)平均為4.7267個，平均期望雜合度 (He)為0.4713，Nei多樣性指數(shù)(h)為0.4560，Shannon 多樣性指數(shù)(I)平均為1.7760。6個群體遺傳多樣性高低順序為：山東昌邑群體>山東河口群體>山東利津群體>

3、山東墾利群體>內(nèi)蒙達茂群體>遼寧盤錦群體。6個群體中，前5個群體遺傳多樣性差別不大，只有遼寧雙臺群體明顯較低，這可能是由于該群體為當?shù)仄鹪吹娜斯ち钟嘘P(guān)。 6個群體的變異主要存在于群體內(nèi)，僅有8.04％的變異(Fst=0.0804)存在于群體間，而GST平均為0.0539，群體的遺傳分化水平在林木中屬中等水平。研究發(fā)現(xiàn)了一些特異的等位基因僅在某一個群體中出現(xiàn)，在某種程度反映了群體間的分化：其中引物 Estssr-15 等位基因豐富

4、，一對引物就能分別將內(nèi)蒙達茂群體和遼寧雙臺群體與起源山東的群體區(qū)分開來。 群體平均觀察雜合度 (Ho)為 0.5364，明顯高于期望雜合度 (He=0.4835)，表明群體中雜合子過量，經(jīng)檢驗顯著顯著偏離Hardy-Weinberg平衡，這可能與采樣時選擇表型優(yōu)良的單株有一定關(guān)系。 針對遺傳變異主要存在于群體內(nèi)，群體間差異與地理距離呈正相關(guān)的特點，在進行遺傳多樣性保護時，應充分重視對于大群體內(nèi)不同類型個體的保存，重點要放