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文檔簡介
1、目的:探討染色體9p21的全基因組關(guān)聯(lián)研究(Genome-wideassociation study,GWAS)陽性位點rs10757274及染色體9p21的1號單倍型區(qū)域位點rs7049105、rs647188、rs1333035與湖南長沙地區(qū)漢族人群大動脈粥樣硬化型腦梗死(Large-arteryatherosclerosis stroke,LAS)的相關(guān)性;探討rs7049105、rs647188、rs1333035位點在有頭頸部
2、動脈粥樣硬化證據(jù)的人群中與LAS的相關(guān)性,為LAS的診斷與治療靶點提供理論依據(jù)。
方法:采用病例對照研究方法收集湖南長沙地區(qū)漢族人群中229例LAS患者為病例組,收集同期門診及體檢中心“健康”人群中233例樣本為對照組1,其中有動脈粥樣硬化證據(jù)的樣本150例(64.38%)納入對照組2,無動脈粥樣硬化證據(jù)的樣本83例(35.62%)納入對照組3。利用基質(zhì)輔助激光解析飛行時間質(zhì)譜(matrix-assisted laserdes
3、orption inoization-time of flight mass spectrometry, MALDI-TOF-MS)方法對樣本進行基因分型檢測,統(tǒng)計分析比較病例組與對照組間rs10757274位點的多態(tài)性分布,并采用Meta分析的方法結(jié)合本次研究及已發(fā)表的rs10757274位點與LAS相關(guān)性研究進行定量分析。接著比較病例組與對照組間rs7049105、rs647188、rs1333035位點的多態(tài)性分布。最后對病例組的
4、相關(guān)危險因素進行Logistic回歸分析。
結(jié)果:
1.病例組與對照組的一般情況比較,在性別、年齡上無統(tǒng)計學(xué)差異,p>0.05,而在BMI、高血壓、糖尿病病史這些方面有統(tǒng)計學(xué)差異,p<0.05。
2.病例組及對照組中染色體9p21位點rs7049105(G/A)、rs1333035(T/C)、rs10757274(A/G)均存在多態(tài)性。rs647188位點只檢測到等位基因A,故不存在多態(tài)性。
3.
5、病例組與對照組間rs10757274位點的多態(tài)性分布比較未發(fā)現(xiàn)統(tǒng)計學(xué)顯著性差異(p>0.05),但在PUBMED數(shù)據(jù)庫中檢索以下關(guān)鍵詞:“rs10757274”、“9p21.3”、“ANRIL”,篩查到7項結(jié)論不相一致的rs10757274位點與LAS相關(guān)性的病例對照研究,結(jié)合本次研究最終納入8項研究進行Meta分析后,總樣本量達23372例(病例組:5311例,對照組:18061例),rs10757274位點在顯性模型(OR=1.23
6、,95%CI=1.08-1.41)、隱性模型(OR=1.28,95%CI=1.01-1.61)、等位基因模型(OR=1.10,95%CI=1.06-1.14)中均與LAS呈現(xiàn)相關(guān)性。
4.病例組與對照組間rs7049105和rs1333035位點的多態(tài)性分布比較結(jié)果如下:①病例組與對照組1間、病例組與對照組3間rs7049105和rs1333035位點的多態(tài)性分布比較未發(fā)現(xiàn)統(tǒng)計學(xué)顯著性差異(p>0.05)。②病例組與對照組2間
7、rs7049105位點的多態(tài)性分布比較未發(fā)現(xiàn)統(tǒng)計學(xué)顯著性差異(p>0.05),病例組與對照組2間rs1333035位點的基因型頻率分布比較發(fā)現(xiàn)有統(tǒng)計學(xué)顯著性差異(p=0.039),其中rs1333035位點在顯性模型(CT+TT/CC)中表現(xiàn)出與LAS相關(guān)的傾向(p=0.144,OR=0.382,95%CI=0.122-1.192),故我們猜測rs1333035的CC基因型可能在有頭頸部動脈粥樣硬化證據(jù)的人群中是LAS的保護性因素。
8、r> 5.對病例組建立多因素Logistic回歸方程分析顯示,經(jīng)校正后納入方程的為高血壓病史、糖尿病病史、BMI。rs1333035多態(tài)性位點未納入回歸方程。
結(jié)論:
1.染色體9p21的rs1333035多態(tài)性在湖南長沙地區(qū)有頭頸部動脈粥樣硬化證據(jù)的漢族人群中與LAS相關(guān),rs1333035位點的CC基因型可能在湖南長沙地區(qū)有頭頸部動脈粥樣硬化證據(jù)的漢族人群中是LAS的保護性因素。
2.染色體9p21的
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