SD大鼠消化道不同部位乳酸桿菌多樣性分析.pdf

1、目的:分析SD大鼠消化道不同部位乳酸桿菌的多樣性
　　方法:3只6周齡正常SD大鼠普通飼料喂養(yǎng)4周后，分別取喂養(yǎng)飼料、胃、小腸近端、小腸遠端、大腸的粘液和內(nèi)容物，提取細菌DNA，采用聚合酶鏈式反應-限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP)方法分析SD大鼠各個部位乳酸桿菌的多樣性。
　　結果:
　　(1)用乳酸桿菌屬通用引物LactoF/R對普通飼料及大鼠四個部位提取的細菌DNA進行PCR擴增，擴增后電泳顯示，普通飼料沒

2、有條帶，其余標本均有條帶。
　　(2)胃部三個16S rDNA部分可變區(qū)域基因文庫中均得到9個相同的操作分類單元(Operational Taxonomic Unit，OTU，基因序列相似性大于98％)，其中6個OTU屬于可培養(yǎng)的乳酸桿菌屬菌株，另外三個屬于不可培養(yǎng)的細菌克隆子。
　　(3)小腸近端三個16S rDNA部分可變區(qū)域基因文庫文庫中分別得到了10，9，10個OTU，樣本1和樣本3的10個OTU相同，樣本2比樣本1

3、和3少了Uncultured Lactobacillus sp.cloneBR15AD06。
　　(4)小腸遠端三個16S rDNA部分可變區(qū)域基因文庫中分別得到了13，12，13個OTU，樣本1和樣本3的13個OTU相同，樣本2比樣本1和3少了Lactobacillus johnsonii CRL1452。
　　(5)大腸三個16S rDNA部分可變區(qū)域基因文庫中分別得到了10，11，9個OTU，其中樣本1少了Uncult

4、ured bacterium clone PF4980，樣本3中少了Uncultured bacterium clone ECN343e07和Lactobacillusintestinalis TH4。
　　結論:
　　(1) SD大鼠胃部、小腸近端、小腸遠端、大腸四個部位的內(nèi)容物及粘液均可檢測到乳酸桿菌。
　　(2)小腸遠端乳酸桿菌菌種多樣性最高，而小腸近端的乳酸桿菌均勻度最高，胃部乳酸桿菌多樣性和均勻度均低于其他檢