癌癥信息學研究：前列腺癌拷貝數(shù)目變異數(shù)據(jù)庫與卵巢癌診斷標志物.pdf

1、癌癥作為世界第二致死率的疾病，已經(jīng)越來受到人們的重視。在中國，癌癥已成為民眾死亡的主要原因。癌癥的早期診斷對于其治療具有重要意義。隨著現(xiàn)代醫(yī)療理念和技術的不斷發(fā)展，以預測性（Predictive）、預防性（Preventive）、個性化（Personalized）、參與性(Participatory）為核心的P4醫(yī)學理論被廣泛認知。
　　我們針對P4醫(yī)學中的個性化和預測性醫(yī)學進行了深入研究。其一，我們構建了有關前列腺癌拷貝數(shù)目變異

2、數(shù)據(jù)庫“CNVPC”，設計了基于LAMP技術的B/S構架下的web在線的前列腺癌拷貝數(shù)目變異數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)。該數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)來源于PubMed的文獻檢索，我們會定期維護并更新數(shù)據(jù)。該數(shù)據(jù)庫不僅具有自動統(tǒng)計功能，而且有檢索功能，用戶可以查詢需要的信息并下載。這里，個性化醫(yī)學著重體現(xiàn)在數(shù)據(jù)庫中對每條變異數(shù)據(jù)信息都有相對應的樣本信息、病人信息以及實驗平臺信息。其二，我們基于 microRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡識別卵巢癌診斷的microRNA生物標

3、志物。MicroRNA是一類具有調(diào)節(jié)基因表達功能的非編碼 RNA，我們通過分析癌癥患者和正常人群的microRNA表達數(shù)據(jù)找到具有差異表達現(xiàn)象的microRNA。重點則是關注于這些microRNA在網(wǎng)絡中獨立調(diào)控基因以及調(diào)控具有重要生物功能的基因（轉(zhuǎn)錄因子）。我們定義了NOD以及TFP兩個新的指標以量化上述兩種能力。在之前的研究中，我們發(fā)現(xiàn)獨立調(diào)控能力強并且調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子基因數(shù)目多的microRNA更適合作為疾病的標志物?；谶@種理論，我