癌癥信息學(xué)研究：前列腺癌拷貝數(shù)目變異數(shù)據(jù)庫與卵巢癌診斷標(biāo)志物.pdf

1、癌癥作為世界第二致死率的疾病，已經(jīng)越來受到人們的重視。在中國，癌癥已成為民眾死亡的主要原因。癌癥的早期診斷對于其治療具有重要意義。隨著現(xiàn)代醫(yī)療理念和技術(shù)的不斷發(fā)展，以預(yù)測性（Predictive）、預(yù)防性（Preventive）、個(gè)性化（Personalized）、參與性(Participatory）為核心的P4醫(yī)學(xué)理論被廣泛認(rèn)知。
　　我們針對P4醫(yī)學(xué)中的個(gè)性化和預(yù)測性醫(yī)學(xué)進(jìn)行了深入研究。其一，我們構(gòu)建了有關(guān)前列腺癌拷貝數(shù)目變異

2、數(shù)據(jù)庫“CNVPC”，設(shè)計(jì)了基于LAMP技術(shù)的B/S構(gòu)架下的web在線的前列腺癌拷貝數(shù)目變異數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)。該數(shù)據(jù)庫中的數(shù)據(jù)來源于PubMed的文獻(xiàn)檢索，我們會(huì)定期維護(hù)并更新數(shù)據(jù)。該數(shù)據(jù)庫不僅具有自動(dòng)統(tǒng)計(jì)功能，而且有檢索功能，用戶可以查詢需要的信息并下載。這里，個(gè)性化醫(yī)學(xué)著重體現(xiàn)在數(shù)據(jù)庫中對每條變異數(shù)據(jù)信息都有相對應(yīng)的樣本信息、病人信息以及實(shí)驗(yàn)平臺(tái)信息。其二，我們基于 microRNA-mRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)識別卵巢癌診斷的microRNA生物標(biāo)

3、志物。MicroRNA是一類具有調(diào)節(jié)基因表達(dá)功能的非編碼 RNA，我們通過分析癌癥患者和正常人群的microRNA表達(dá)數(shù)據(jù)找到具有差異表達(dá)現(xiàn)象的microRNA。重點(diǎn)則是關(guān)注于這些microRNA在網(wǎng)絡(luò)中獨(dú)立調(diào)控基因以及調(diào)控具有重要生物功能的基因（轉(zhuǎn)錄因子）。我們定義了NOD以及TFP兩個(gè)新的指標(biāo)以量化上述兩種能力。在之前的研究中，我們發(fā)現(xiàn)獨(dú)立調(diào)控能力強(qiáng)并且調(diào)控轉(zhuǎn)錄因子基因數(shù)目多的microRNA更適合作為疾病的標(biāo)志物。基于這種理論，我