SH2B1和TBC1D1基因多態(tài)性與家兔生長性狀以及部分屠宰和肉質性狀的關聯(lián)分析.pdf

1、SH2B1和TBC1D1是胰島素信號通路上具有生物學作用的信號因子，在胰島素信號通路調節(jié)葡萄糖攝取的過程中發(fā)揮關鍵作用。本試驗通過直接測序技術檢測SH2B1部分mRNA序列和TBC1D1基因編碼區(qū)序列的SNPs位點，采用HRM技術、RFLP技術和生物質譜技術對5個家兔品種共722個樣本的候選SNPs位點進行基因分型;應用最小二乘法對SH2B1和TBC1D1基因SNPs位點與家兔多個生產性狀進行關聯(lián)分析;采用實時熒光定量技術檢測35日齡，

2、56日齡，70日齡肝臟組織中SH2B1基因mRNA相對表達量，分析不同發(fā)育階段以及不同基因型mRNA相對表達量的關聯(lián)性。試驗結果如下:
　　(1) SH2B1基因mRNA的3'UTR區(qū)檢測到2個SNPs位點，分別為r.*464T＞C和r.*749 G＞A; TBC1D1基因檢測到12個SNPs位點，其中7個同義突變SNPs位于TBC1D1的TBC結構域(c.2451G＞A，c.2514A＞G,c.2535G＞A，c.2589G＞A

3、，c.2763T＞C，c.2844T＞C，c.2937G＞T)，4個同義突變位點(c.153T＞C，c.252A＞G,c.564G＞A，c.591G＞A)和一個非同義突變c.214G＞A(Gly72Arg)分布在兩個PTB結構域上。根據mRNA中3'UTR區(qū)和非同義突變的生物學功能，本實驗對SH2B1基因的r.*464 T＞C位點和TBC1D1基因c.214G＞A位點于家兔的生產性狀進行分析。
　　(2) SH2B1基因r.*46

4、4 T＞C位點在新西蘭兔(288)、香檳兔(74)，伊拉兔(85)和天府黑兔(56)中均檢測到CC、TC和TT3種基因型。新西蘭兔3種基因型頻率分別為0.177、0.576和0.247，香檳兔3種基因型頻率分別為0.24、0.554和0.203，伊拉兔3種基因型頻率分別為0.083、0.435和0.482，天府黑兔3種基因型頻率分別為0.089、0.661和0.250;在新西蘭兔，伊拉兔和天府黑兔中T等位為優(yōu)勢等位基因，頻率分別為0.5

5、35、0.700和0.58.0，而在香檳兔中C等位基因為優(yōu)勢等位基因，頻率為0.520。r.*464 T＞C位點在4個品種中表現(xiàn)為中度遺傳多態(tài)。
　　(3) TBC1D1基因c.214G＞A位點在歐洲大白兔(206)、新西蘭兔(287)、香檳兔(81)，伊拉兔(87)和天府黑兔(61)中均檢測到AA、GA和GG3種基因型。歐洲大白兔3種基因型頻率分別為0.639、0.278和0.083，新西蘭兔3種基因型頻率分別為0.489、0.

6、357和0.154，香檳兔3種基因型頻率分別為0.012、0.086和0.902，伊拉兔3種基因型頻率分別為0.011、0.138和0.851天府黑兔3種基因型頻率分別為0.016、0.197和0.787;在歐洲大白兔和新西蘭兔中，A等位基因為優(yōu)勢基因基因，頻率分別為0.780和0.670，c.214G＞A位點表現(xiàn)為中度遺傳多態(tài)性;在伊拉兔，香檳兔和天府黑兔中G等位基因為優(yōu)勢等位基因，頻率分別為0.919、0.944和0.885，c.2

7、14G＞A位點表現(xiàn)為低度遺傳多態(tài)性。
　　(4) SH2B1基因r.*464 T＞C位點各基因型與生產性狀關聯(lián)分析結果表明，新西蘭兔中，CT基因型個體56日齡體重、35-56日齡日增重(ADG35-56)顯著(P＜0.05)高于CC基因型個體;伊拉兔中，CC基因型個體84日齡體重、日增重ADG70-84顯著（P＜0.05）或極顯著(P＜0.01)高于TT基因型、CC基因型個體。在香檳兔中，TT基因型個體的全凈膛重、半凈膛重顯著(P

8、＜0.05)高于CC基因型，CC基因型的背最長肌肌間脂肪含量顯著(P＜0.05)高于TT基因型。表明SH2B1基因r.*464 T＞C位點遺傳變異及與生長性狀的關聯(lián)性具有品種差異，該位點對屠宰性狀和肉質性狀的影響不一致，TT基因型在香檳兔中具有較高的屠宰性狀，CC基因型具有較高的肉質性狀。
　　(5) TBC1D1基因c.214G＞A位點各基因型與生產性狀關聯(lián)分析結果表明，新西蘭兔中，AA基因型和GA基因型個體的35日齡體重極顯著

9、(P＜0.01)高于GG基因型，歐洲大白兔中，GA基因型個體的56日齡重和日增重ADG35-56顯著(P＜0.05)高于GG基因型個體。說明等位基因A分別對兩個群體的35日齡重和56日齡重有正效應。
　　(6) SH2B1基因mRNA相對表達量在家兔肝臟組織隨著日齡的增長而上升，70日齡時SH2B1基因mRNA相對表達量極顯著(P＜0.01)高于35日齡，顯著(P＜0.05)高于56日齡，35日齡和56日齡之間的差異不顯著（P＞0

10、.05），表明SH2B1基因mRNA表達具有發(fā)育階段性。SH2B1基因r.*464 T＞C位點不同基因型與SH2B1基因mRNA相對表達量之間的差異未達到顯著水平(P＞0.05)，表明SH2B1基因r.*464 T＞C位點多態(tài)性與SH2B1基因mRNA相對表達量相關不顯著。
　　本研究表明，SH2B1基因r.*464 T＞C位點和TBC1D1基因c.214G＞A位點可以作為與家兔生長速度、屠宰和肉質性能的遺傳標記，但存在品種差異。