皮膚毛囊基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的初建及其在絨山羊上的功能預(yù)測(cè).pdf

1、對(duì)絨山羊皮膚毛囊的研究將有助于進(jìn)一步了解絨毛生長(zhǎng)的分子調(diào)控機(jī)理，這已經(jīng)成為絨山羊研究的核心和關(guān)鍵。本研究通過(guò)文獻(xiàn)挖掘查找與毛囊生長(zhǎng)發(fā)育相關(guān)的候選基因，建立毛囊發(fā)育相關(guān)分子數(shù)據(jù)庫(kù)，用自然語(yǔ)言處理的方法對(duì)數(shù)據(jù)庫(kù)中的分子進(jìn)行了相關(guān)性分析，進(jìn)而構(gòu)建了毛囊發(fā)育基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)，Pajek可視化網(wǎng)絡(luò)后又用圖論的方法進(jìn)行了初步分析，并進(jìn)行了其在絨山羊絨毛生長(zhǎng)機(jī)理研究中的功能預(yù)測(cè)，結(jié)果如下： 1 在與毛囊發(fā)育相關(guān)的分子數(shù)據(jù)庫(kù)中，共包含分子215個(gè)，

2、其中Wnt、TGF-β、MAPK、Shh、JAK-STAT和Notch信號(hào)通路的分子分別占到分子總數(shù)的13.95％、10.23％、19.53％、3.72％、2.87％和1.40％。 2 對(duì)網(wǎng)絡(luò)圖的分析結(jié)果表明： 1) 網(wǎng)絡(luò)中節(jié)點(diǎn)的重要性排在前10位的分子是：IL2/3/4/6、TNF-α/Eda、Ca<'2+>、TGF-β、GRB2、JNK、β-catenin、TrkB/C、TCF/LEF、Zic2，其中GRB2、Ca<

3、'2+>和Zic2前人研究相對(duì)較少，據(jù)網(wǎng)絡(luò)圖推測(cè)可能GRB2在毛囊的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用，Ca<'2+>在介導(dǎo)分子及通路間信號(hào)的傳導(dǎo)中發(fā)揮橋梁作用，而Zic2常作為領(lǐng)導(dǎo)者執(zhí)行生物功能。 2) 有六個(gè)信號(hào)通路在毛囊的生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程中起著重要作用：它們是：Wnt、TGF-β、MAPK、Shh、Notch和JAK-STAT，一般情況下，MAPK常作為執(zhí)行者來(lái)發(fā)揮作用，TGF-β信號(hào)通路常作為領(lǐng)導(dǎo)者來(lái)激活其它信號(hào)通路，Wnt