密穗小麥α-醇溶蛋白基因5’上游調(diào)控區(qū)及編碼區(qū)序列分析.pdf

1、四川農(nóng)業(yè)大學(xué)碩士學(xué)位論文密穗小麥α醇溶蛋白基因5’上游調(diào)控區(qū)及編碼區(qū)序列分析姓名：舒曉霞申請學(xué)位級(jí)別：碩士專業(yè)：植物資源的保護(hù)與利用指導(dǎo)教師：鄭有良20080501PIl918744c、P135230212D、PIl918。741B、P1352302719、P15665948B、Pi566394一lA、P12692505B、P1566594—913、P1566594lU—B、P12692508一C、P15665945A、勉6嚦DJJC、

2、1156659444和P12鑼乃03C來自于A染色體組，麗膏礬P15665943A、1126925010C、P11591013t3、P13523029B、P13523025C、P15665947一B、P12692506一B、P13523028B、P15665942A、PIl591011A、PIl59IOI2A和P11918743C來自于D染色體組，序列P12692504i)和112692509一C來自B染色體組。2從5份供試材料中共克隆

3、到51條Q醇溶蛋白基因5’上游調(diào)控區(qū)序列，長度從216bp到436bp不等。對長度大于380bp的19條序列進(jìn)行了分析，各序列均表現(xiàn)出堿基A含量最高，T和C其次，G含量最少。19條序列的平均相似值為92％，序列P[1918743C與序列PI_2692502C相似值最低(83％)，序列胍6酊94J5G與P1566594150G、以及P12692502C與P156659411C相似值最高(100％)。所得密穗小麥序列與其他物種序列平均相似值

4、為719％，與普通小麥序列X54688的相似值為929％，與簇毛麥的相似值為918％，而與野生智利大麥的相似僅為46O％。序列P156659415G，P156659416G。P12692501C。PIl918742c。PIl918743c，PIl591015G幫P13523022C在調(diào)控區(qū)出現(xiàn)了51bp的缺失。同時(shí)，各序列中還存在堿基缺失和單核苷酸多態(tài)性。與其它小麥屬洳醇溶蛋白基因5’調(diào)控區(qū)序列類似，19個(gè)密穗小麥調(diào)控區(qū)序列中均含有與基

5、因表達(dá)相關(guān)的重要調(diào)控元件，包括胚乳基序元件TGTAAAG、GCN4類似元件ATGAGTCAT、CAAT框、AAAG基序、TATA框、GCN4類似基序[ATGAC(T)GATCAT]以及CACbox，同時(shí)在序列中出現(xiàn)了AACAmotif。序列比對表明密穗小麥與普通小麥和烏拉爾圖小麥a醇溶蛋白5’上游調(diào)控區(qū)存在較為豐富的變異，遺傳差異較大。對各序列的5’上游調(diào)控區(qū)進(jìn)行聚類分析，結(jié)果發(fā)現(xiàn)基于調(diào)控區(qū)序列不能完全區(qū)分材料的種屬，但根據(jù)已知染色體位