中國漢族人群多發(fā)性肌炎-皮肌炎的候選基因關(guān)聯(lián)分析研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、目的:特發(fā)性炎性肌病(idiopathic inflammatory myopathies,IIM)致病或發(fā)病機(jī)制是由基因和環(huán)境因素共同作用的一種自身免疫病。多發(fā)性肌炎(polymyositis,PM)和皮肌炎(dermatomyositis,DM)是IIM最常見的兩種臨床亞型。最近,歐洲和日本人群的全基因組關(guān)聯(lián)分析研究(genome-wide association study,GWAS)發(fā)現(xiàn)FAM167A-BLK基因是DM的候選基因

2、。單核苷酸多態(tài)性(single-nucleotidepolymorphisms,SNP)研究表明TNFAIP3,IFIH1和IRF5基因SNP位點(diǎn)與多種自身免疫病相關(guān),然而,這三個(gè)基因上的SNP是否與IIM相關(guān)目前尚不清楚。本實(shí)驗(yàn)的目的是探討TNFAIP3,IFIH1,IRF5和FAM167A-BLK基因SNP位點(diǎn)與中國漢人IIM之間的相關(guān)性。
  方法:310例PM患者,541例DM患者和968健康對(duì)照者在中國漢人中收集。選擇T

3、NFAIP3基因上rs2230926和rs5029939位點(diǎn),IFIH1基因上的rs1990760和rs3747517位點(diǎn),IRF5基因上的rs4728142位點(diǎn),F(xiàn)AM167A-BLK基因上的rs2736340,rs7812879,rs13277113,rs2618479,rs2254546和rs2248932位點(diǎn)。采用Sequenom MassArray質(zhì)譜方法對(duì)以上SNP位點(diǎn)進(jìn)行基因分型。
  結(jié)果:我們的研究表明TNFAI

4、P3基因上的rs2230926位點(diǎn)(P=0.03, p=8.0×10-4和P=1.5×10-3)和rs5029939位點(diǎn)(P=0.02,p=1.1×10-3和p=1.2×10-3),IRF5基因上的rs4728142位點(diǎn)(P=0.01,P=0.04和p=5.2×10-3),F(xiàn)AM167A-BLK基因上的rs2736340位點(diǎn)(P=0.02,p=2.24×10-3和P=1.08×10-3),rs7812879位點(diǎn)(P=0.029,p=6.

5、74×10-3和P=2.79×10-3),rs13277113位點(diǎn)(P=0.016, p=7.77×10-3和p=1.77×10-3)和rs2618479位點(diǎn)(P=0.035,P=0.023和p=6.69×10-3)等位基因頻率在DM,PM和PM/DM患者中具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。rs2230926和rs5029939位點(diǎn)形成的CT單體型以及rs2736340,rs7812879,rs13277113,rs2618479和rs2254546位點(diǎn)

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