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文檔簡(jiǎn)介
1、第一部分:
目的:
多發(fā)性硬化(MS)與視神經(jīng)脊髓炎(NMO)是常見的中樞神經(jīng)系統(tǒng)脫髓鞘性疾病。目前全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS),除人白細(xì)胞抗原(HLA)基因外,還發(fā)現(xiàn)許多非HLA基因與MS相關(guān)。本研究基于國(guó)外人群MS的GWAS結(jié)果,在中國(guó)漢族人群中篩選MS的非HLA關(guān)聯(lián)基因。
方法:
收集2007-2012年復(fù)旦大學(xué)附屬華山醫(yī)院和福建醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院門診及住院確診的MS患者154例和NMO患
2、者109例以及對(duì)照301例。采用基質(zhì)輔助激光解吸電離飛行時(shí)間質(zhì)譜技術(shù)(MALDI-TOFMS),對(duì)病例組及對(duì)照組標(biāo)本的71個(gè)單核苷酸多態(tài)性(SNPs)進(jìn)行分型。
結(jié)果:
1、MS組與對(duì)照組比較,僅有7個(gè)SNP位點(diǎn)的基因頻率分布存在顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異:rs11129295/EOMES(P=0.008,OR=1.559),rs2293370/TMEM39A(P=0.018,OR=0.695),rs703842/CYP27B1
3、(P=0.036,OR=1.354),rs7522061/FCRL3(P=0.0003,OR=0.593),rs3761959/FCRL3(P=0.0005,OR=0.601),rs7528684/FCRL3(P=0.0007,OR=0.616),rs10466829/CLECL1(P=0.026,OR=0.724);
2、NMO組與對(duì)照組比較,僅有6個(gè)SNP位點(diǎn)的基因頻率分布存在顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異:rs1800693/TNFRS
4、F1A(P=0.032,OR=1.574),rs7522061/FCRL3(P=0.009,OR=0.658),rs3761959/FCRL3(P=0.014,OR=0.678),rs7528684/FCRL3(P=0.026,OR=0.701),rs6937876/ATG5(P=0.023,OR=1.449),rs763361/CD226(P=0.036,OR=1.404)。
結(jié)論:
1、來(lái)自高加索人群MS的GWA
5、S結(jié)果大部分不適用中國(guó)漢族人群MS;
2、FCRL3基因是中國(guó)漢族人群中與MS關(guān)聯(lián)性最強(qiáng)的易感基因;
3、FCRL3基因與中國(guó)漢族人群MS和NMO均具有相關(guān)性。
第二部分:
目的:
在前部分中,我們研究發(fā)現(xiàn)FCRL3基因與中國(guó)漢族人群MS和NMO相關(guān)聯(lián)。在這部分,我們將進(jìn)一步探討FCRL3基因與MS和NMO表型的關(guān)系,特別是與寡克隆帶(OCB)和AQP4抗體(AQP4-ab)兩種抗體之間
6、的關(guān)系;初步探討FCRL3基因在MS發(fā)病過程中的可能機(jī)制。
方法:
采用等電點(diǎn)聚焦技術(shù)檢測(cè)OCB;采用免疫熒光技術(shù)檢測(cè)AQP4-ab。收集MS患者34例和對(duì)照41例的外周血單核細(xì)胞RNA標(biāo)本,采用實(shí)時(shí)定量PCR技術(shù)檢測(cè)標(biāo)本中FCRL3基因mRNA相對(duì)表達(dá)水平。
結(jié)果:
1、FCRL3基因的4個(gè)SNP位點(diǎn)中,rs7528684位點(diǎn)與rs376195位點(diǎn)及rs7522061位點(diǎn)呈強(qiáng)連鎖關(guān)系,而rs11
7、264799位點(diǎn)與前述3個(gè)SNP位點(diǎn)呈弱連鎖關(guān)系(平均R2=0.41)。
2、邏輯回歸分析結(jié)果:在顯性模型中,rs7528684位點(diǎn)的C等位基因?yàn)镸S組的保護(hù)因素(CT+CCvsTT,p=0.002,OR=0.528),而rs11264799位點(diǎn)的A等位基因?yàn)镹MO的保護(hù)因素(AG+AAvsGG,p=0.005,OR=0.492)。
3、TG單倍體型(rs7528684和rs11264799)為MS的風(fēng)險(xiǎn)因素(p=0
8、.003,OR=1.534),而CG單倍體型為MS組的保護(hù)因素(p=0.012,OR=0.613);TG單倍體型為NMO組的風(fēng)險(xiǎn)因素(p=0.012,OR=1.509),而CA單倍體型為NMO組的保護(hù)因素(p=0.015,OR=0.617)。
4、rs7528684位點(diǎn)和rs11264799位點(diǎn)與MS患者起病時(shí)間(AAO)和疾病嚴(yán)重程度(EDSS)無(wú)關(guān),也與NMO患者起病時(shí)間(AAO)無(wú)關(guān)。
5、在MS組中,依據(jù)0C
9、B狀態(tài)分層,rs7528684位點(diǎn)的基因型在陰陽(yáng)性組中存在明顯的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(p=0.002),rs7528684位點(diǎn)的C等位基因與0CB的出現(xiàn)呈負(fù)相關(guān)(p=1.488×10-4,OR=0.354);rs7528684位點(diǎn)的C等位基因?yàn)?CB陽(yáng)性的MS患者保護(hù)因素(p=5.650×10-6,OR=0.392),而與0CB陰性的MS患者無(wú)相關(guān)性(p=0.636)。在NMO組中,依據(jù)AQP4-ab狀態(tài)分層,rs11264799位點(diǎn)的基因型在陰
10、陽(yáng)性組中無(wú)明顯的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(p=0.383);rs11264799位點(diǎn)與AQP4-ab的出現(xiàn)無(wú)相關(guān)性(p=0.214)。
6、在對(duì)照組中,不同基因型FCRL3基因mRNA表達(dá)存在明顯的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,CC基因型較其他基因型明顯增高(CCvsTT,p=0.021;CCvsCT,p=0.025);在MS組中,不同基因型FCRL3基因mRNA表達(dá)存在明顯的統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(CCvsTT,p=0.013;CCvsCT,p=0.045)。對(duì)于相同
11、基因型CC,MS組的FCRL3基因mRNA表達(dá)明顯高于對(duì)照組(p=2.481×10-4);對(duì)于相同基因型CT,MS組的FCRL3基因mRNA表達(dá)明顯高于對(duì)照組(p=1.982×10-5);對(duì)于相同基因型TT,MS組的FCRL3基因mRNA表達(dá)明顯高于對(duì)照組(p=0.029)。
結(jié)論:
1、在中國(guó)漢族MS患者中,FCRL3基因rs7528684位點(diǎn)的C等位基因與OCB的出現(xiàn)呈負(fù)相關(guān)。在中國(guó)漢族NMO患者中,FCRL3基
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