非小細胞肺癌分泌蛋白的定量研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、肺癌(lung cancer)是全世界發(fā)病率和死亡率最高的惡性腫瘤之一,非小細胞肺癌約占肺癌總數(shù)的80-85%,嚴重影響人們的生活質量。目前,關于這類疾病的發(fā)病機理仍然不清楚,其發(fā)生、發(fā)展的分子機理亟待闡明。近年來質譜技術發(fā)展迅速,為腫瘤研究提供了有力的研究手段。本實驗利用2D LC-MS/MS蛋白質組學平臺,結合同位素標記相對和絕對定量(isobaric Tags for Relative andAbsolute Quantitati

2、on,iTRAQ)技術以及SWATHTM(Sequential WindowedAcquisition of all Theoretical fragment ions,SWATHTM)非標記定量技術分析比較一對具有不同轉移潛能肺癌細胞系SPC-A-1 sci和SPC-A-1的差異分泌蛋白,篩選肺癌轉移相關分子。
  第一部分:血清蛋白組分析方法的初步建立。利用安捷倫免疫親和色譜系統(tǒng)有效去除人血清中14個血清高豐度蛋白,有利于下一

3、步質譜鑒定出更多血清低豐度蛋白,為之后的實驗研究奠定基礎。去除高豐度蛋白后的血清,利用iTRAQ標記定量方法定量比較正常人與肺癌早期、中期及晚期病人的血清蛋白。
  第二部分:NSCLC轉移相關分泌蛋白的定量分析。利用iTRAQ標記定量技術和SWATHTM非標記定量技術同時分析SPC-A-1sci和SPC-A-1的差異分泌蛋白,并分析、整合兩種方法的定量效果,結果顯示在兩種方法中重復鑒定與定量的蛋白有326個,差異表達的蛋白110

4、個,經(jīng)過生物信息數(shù)據(jù)庫軟件預測,有96%的蛋白可通過分泌途徑分泌。應用實時定量PCR(Quantitative Real-time PCR,qRT-PCR)與蛋白質印跡法(Western blot)檢測差異蛋白在基因與蛋白水平的表達情況,結果與質譜定量趨勢基本一致。
  此外,運用第一部分中蛋白組學分析血清的方法,比較早期肺癌病人組(Ⅰ和Ⅱ期)和晚期肺癌病人組(Ⅲ和Ⅳ期)的血清差異蛋白,共鑒定差異蛋白71個。ELISA檢測質譜鑒定

5、結果中差異最顯著的蛋白(Complement C3)在血清樣本中的表達情況,結果與質譜分析一致。結合血清和分泌上清的差異表達數(shù)據(jù)結果,發(fā)現(xiàn)CD109同時在晚期肺癌病人和高轉移潛能肺癌細胞高表達,提示其可能與肺癌發(fā)生發(fā)展密切相關,具有潛在研究價值。
  第三部分:CD109表達量檢測及生物功能的初步研究。qRT-PCR檢測CD109在72對肺癌病人癌和癌旁組織中的表達,顯示CD109在癌組織中顯著增高,且在低分化肺癌組織中高表達。E

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