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文檔簡介
1、Discodermolide和dictyostatin是新穎的作用于微管蛋白的抗腫瘤化合物,具有良好的藥用前景。 我們用比較分子力場分析(CoMFA)和比較分子相似性指數(shù)分析(CoMSIA)對discodermolide及其衍生物進行了三維定量構效關系(3D-QSAR)的研究,并建立了相關的預測模型。其中,CoMFA模型的交叉驗證相關系數(shù)(q2)為0.592,非交叉驗證相關系數(shù)(r2)為0.982,標準偏差(SEE)為0.094
2、,F(xiàn)值為119.761;CoMSIA模型的q2為0.544.,r2為0.980,SEE為0.098,F(xiàn)值為108.715。計算結果表明,獲得的CoMFA和CoMSIA模型具有良好的預測能力,可以應用于指導該類化合物的設計。通過分析CoMFA和CoMSIA模型可發(fā)現(xiàn),在內酯環(huán)上引入體積較大、電正性強的親水取代基團,在C1位引入體積較小的電負性的疏水基團,在C19位引入體積較大、電正性強的氫鍵受體,均有利于化合物活性的提高。 此外,
3、我們對dictyostatin進行了分子對接,并對分子對接后得到的dictyostatin和微管蛋白復合物進行了分子動力學模擬,得到比較接近實際情況的復合物結構,最后我們分析了dictyostatin與微管蛋白之間的具體作用方式。分析結果表明:dictyostatin與微管蛋白主要通過氫鍵作用和靜電作用相結合。Dictyostatin和微管蛋白之間共形成3對氫鍵,分別是C1位的酮基氧原子與蘇氨酸273的氫原子形成了一對氫鍵、C9位的羥基
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