利用GST pull-down方法篩查PAD4相互作用蛋白的初步研究.pdf_第1頁
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文檔簡介

1、GST pull-down法作為蛋白質相互作用的體外研究方法之一,簡單、方便、易操作,但研究未知的蛋白質相互作用難度較大,少有報道;肽?;彼崦搧啺访?(Peptidyl Arginine Deiminase typeⅣ, PAD4)作為類風濕性關節(jié)炎(RheumatoidArthritis,RA)易感基因,其介導的組蛋白瓜氨酸化是哺乳類固有免疫-中性粒細胞胞外陷阱(Neutrophil Extracellular Traps,NET

2、)形成的必要條件。PAD4也可以作為共抑制因子下調(diào)抗癌基因P53誘導的下游基因的表達,被認為參與了腫瘤的發(fā)生,但具體作用機制尚不清楚;PAD4主要在免疫細胞中表達,是五種肽?;彼崦搧啺访钢形ㄒ痪哂泻硕ㄎ恍盘柕牡鞍锥嚯墓习彼峄浮嶒炇彝ㄟ^蛋白免疫印跡發(fā)現(xiàn)TNF-α有誘導HL-60細胞中PAD4蛋白核轉移現(xiàn)象,PAD4蛋白核轉移后分子量變大,推測入核過程中可能與其他蛋白發(fā)生相互作用。明確其核轉移時相互作用蛋白及闡明其核轉運機制,對于認

3、識PAD4在正常生理狀態(tài)和病變情況下的基因功能具有重要的意義,實驗室選取HL-60細胞,利用GST pull-down assay在這方面進行了初步探索。
  目的:構建GST-PAD4載體及核定位信號缺失載體GST-PAD4-NLS-,通過優(yōu)化表達條件得到高純度融合蛋白GST-PAD4及GST-PAD4-NLS-,用GST pull-down assay初步尋找PAD4核轉移時與之相互作用的蛋白。
  方法:用TNF-α處

4、理HL-60細胞,蛋白免疫印跡觀察PAD4在HL-60細胞中核轉移,然后構建帶有GST標簽的PAD4以及PAD4核定位信號缺失(PAD4-NLS-)的原核表達載體;通過轉化大腸桿菌BL21菌株,獲得重組蛋白表達的工程菌,經(jīng)過優(yōu)化誘導表達條件,獲得重組蛋白的可溶性表達;再利用Sepharose4B親和層析法分別純化出重組蛋白GST-PAD4以及GST-PAD4-NLS-,將純化的重組蛋白分別固定在谷胱甘肽瓊脂糖凝膠(Sepharose4B

5、)上,與來源于HL-60細胞中的總蛋白共同孵育,富集可能與GST-PAD4以及GST-PAD4-NLS-發(fā)生相互作用的蛋白;最后經(jīng)SDS-PAGE聯(lián)合銀染初步尋找可能與PAD4或PAD4-NLS-發(fā)生相互作用的蛋白。
  結果:蛋白免疫觀印跡察到TNF-α有誘導PAD4在HL-60細胞中核轉移現(xiàn)象,PAD4入核后分子量變大,TNF-α誘導2h左右PAD4入核現(xiàn)象明顯;優(yōu)化獲得融合蛋白GST-PAD4最佳可溶性表達條件:16℃下菌液

6、OD600約為0.4時加入0.1mM IPTG誘導12h以上,在這一條件下獲得高純度的融合蛋白GST-PAD4以及GST-PAD4-NLS-;利用GST pull-down方法捕獲到PAD4核轉移時可能與之相互作用的蛋白并利用SDS-PAGE聯(lián)合銀染的方法進行了初步分析。
  結論:觀察到TNF-α誘導PAD4核轉移后有分子量增加的現(xiàn)象;通過優(yōu)化表達條件可以獲得高純度的融合蛋白;利用GST pull-down方法初步篩查到一條與P

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